More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1300 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1300  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
794 aa  1630    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.91877 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1755  glutaminyl-tRNA synthetase  74.97 
 
 
802 aa  1201    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0681  glutaminyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
748 aa  686    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.480313  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2188  glutaminyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 
816 aa  923    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00249648  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1263  glutaminyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
781 aa  631  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.578242  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 
554 aa  600  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
565 aa  590  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
564 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 
555 aa  591  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
556 aa  591  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
565 aa  586  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 
556 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
567 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 
569 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  50 
 
 
566 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
567 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
553 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
567 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
567 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
568 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
561 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2599  glutaminyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 
778 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0790772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
555 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
556 aa  580  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
552 aa  581  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
580 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
556 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00970277  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
564 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
552 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
565 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
552 aa  574  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 
570 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
556 aa  571  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
570 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1249  glutaminyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 
777 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1350  glutaminyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 
777 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0295693  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
576 aa  567  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
555 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  48 
 
 
568 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
569 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
555 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
561 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 
555 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
564 aa  562  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 
565 aa  559  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
569 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
587 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 
552 aa  558  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
569 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
596 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
572 aa  557  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
569 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
556 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 
569 aa  557  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
565 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
569 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
569 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
589 aa  555  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
569 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
569 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 
582 aa  558  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
580 aa  554  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
576 aa  555  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
569 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
569 aa  555  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
559 aa  555  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
555 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
555 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
552 aa  553  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
555 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
558 aa  554  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
576 aa  555  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
555 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 
548 aa  555  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
569 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
555 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 
557 aa  554  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
551 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
551 aa  549  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
569 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 
579 aa  550  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
555 aa  550  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1012  glutaminyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
705 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 
563 aa  551  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
569 aa  551  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
582 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
569 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
558 aa  551  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
552 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
552 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
565 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
554 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
554 aa  545  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
558 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  47.12 
 
 
554 aa  545  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
554 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
554 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0922  glutaminyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
559 aa  546  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 
580 aa  548  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
569 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>