More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3294 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 554 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 		 540 aa  737    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3294  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 565 aa  1173    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000133432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 572 aa  635    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 568 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 563 aa  656    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 565 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  59.89 
 
 		 565 aa  697    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  60.94 
 
 		 561 aa  700    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  63.14 
 
 		 552 aa  724    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  63.32 
 
 		 552 aa  726    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 587 aa  641    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 565 aa  637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 589 aa  692    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  58.83 
 
 		 564 aa  687    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 565 aa  636    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  62.04 
 
 		 580 aa  719    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  55.68 
 
 		 562 aa  632  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 556 aa  634  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  57.54 
 
 		 555 aa  634  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  57.22 
 
 		 564 aa  631  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2082  glutaminyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 		 596 aa  628  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 563 aa  628  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 		 564 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  54.96 
 
 		 553 aa  627  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 		 567 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 569 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 569 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 560 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 		 565 aa  623  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 570 aa  622  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 561 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 		 568 aa  624  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 555 aa  622  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 		 567 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 567 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 570 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 		 567 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 561 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 583 aa  618  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 561 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 		 552 aa  616  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 556 aa  617  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 566 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 556 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 555 aa  612  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 565 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 565 aa  612  9.999999999999999e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 557 aa  610  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 556 aa  611  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  55.9 
 
 		 548 aa  608  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 555 aa  610  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 559 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03410  glutaminyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 555 aa  606  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 569 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  55.84 
 
 		 557 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 569 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 556 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 555 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 555 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1220  glutaminyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 573 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 555 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 555 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 555 aa  602  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 		 579 aa  601  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3475  glutaminyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 580 aa  598  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 559 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1133  glutaminyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 579 aa  598  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.613915  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 576 aa  600  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 558 aa  598  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 582 aa  599  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 555 aa  601  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 558 aa  601  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1012  glutaminyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 705 aa  599  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 		 569 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 554 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 554 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 554 aa  595  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 554 aa  596  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 582 aa  595  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 573 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 		 569 aa  598  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 569 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 554 aa  597  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 569 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 569 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 569 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 569 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  54.35 
 
 		 569 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 554 aa  596  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 569 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 552 aa  596  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 553 aa  596  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  53.1 
 
 		 554 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 569 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 569 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 569 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 554 aa  595  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>