188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0533 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0533  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  65.17 
 
 		 400 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.46 
 
 		 407 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.79 
 
 		 399 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  57.29 
 
 		 399 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  48.96 
 
 		 408 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 		 425 aa  87.8  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  52.58 
 
 		 413 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  53.12 
 
 		 413 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  50.59 
 
 		 392 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.59 
 
 		 392 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1928  Na+/H+ antiporter NhaA  51.72 
 
 		 376 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3487  Na+/H+ antiporter NhaA  54.26 
 
 		 395 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.16157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4502  Na+/H+ antiporter NhaA  47.47 
 
 		 400 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0600  Na+/H+ antiporter NhaA  46.59 
 
 		 424 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.67 
 
 		 393 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.05 
 
 		 391 aa  77  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  48.24 
 
 		 391 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5944  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.96 
 
 		 396 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.06 
 
 		 391 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  47.96 
 
 		 399 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7108  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.96 
 
 		 396 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937929  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  45.26 
 
 		 401 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.05 
 
 		 393 aa  73.6  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.05 
 
 		 420 aa  73.6  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  42.42 
 
 		 424 aa  72.8  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  47.13 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2430  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.19 
 
 		 393 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.16 
 
 		 397 aa  71.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.28 
 
 		 397 aa  70.5  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.96 
 
 		 390 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  44.83 
 
 		 391 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.23 
 
 		 409 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.57 
 
 		 396 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.15 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  46.67 
 
 		 393 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  42.05 
 
 		 460 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.15 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  40 
 
 		 391 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.21 
 
 		 391 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.76 
 
 		 382 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  44.32 
 
 		 382 aa  64.7  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  41.18 
 
 		 455 aa  63.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.05 
 
 		 391 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.48 
 
 		 400 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0343  Na+/H+ antiporter NhaA  38.82 
 
 		 390 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00697449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  43.53 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.8 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.76 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.8 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.78 
 
 		 400 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.78 
 
 		 400 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.23 
 
 		 394 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  41.41 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  34.34 
 
 		 383 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  41.46 
 
 		 438 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  37.11 
 
 		 406 aa  60.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  36.47 
 
 		 396 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.21 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  37.5 
 
 		 394 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.84 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  38.37 
 
 		 402 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.24 
 
 		 399 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  39.53 
 
 		 470 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  38 
 
 		 395 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4144  Na+/H+ antiporter NhaA  38.75 
 
 		 472 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.375457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  35.71 
 
 		 453 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  36.47 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 		 451 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  47.22 
 
 		 630 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  50 
 
 		 436 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  36.47 
 
 		 451 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0696  Na+/H+ antiporter-like protein  45.88 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00158966  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  38.82 
 
 		 446 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  40.66 
 
 		 434 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.98 
 
 		 449 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  39.47 
 
 		 444 aa  54.3  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  39.18 
 
 		 455 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1489  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.21 
 
 		 384 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2293  Na+/H+ antiporter NhaA  37.5 
 
 		 395 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.193594 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  35.29 
 
 		 382 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  45.16 
 
 		 465 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  34.12 
 
 		 382 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  36.26 
 
 		 395 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  38.82 
 
 		 427 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2448  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.02 
 
 		 382 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2304  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.1 
 
 		 384 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.71 
 
 		 401 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.5 
 
 		 389 aa  52  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2336  Na+/H+ antiporter NhaA  40.48 
 
 		 403 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000768129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.54 
 
 		 389 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.74 
 
 		 391 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  33.72 
 
 		 386 aa  52.4  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  39.73 
 
 		 432 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.12 
 
 		 391 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.74 
 
 		 391 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  35.11 
 
 		 514 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.37 
 
 		 391 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.74 
 
 		 389 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.21 
 
 		 450 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>