57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0410 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0410  xylose isomerase-like TIM barrel  100 
 
 		 285 aa  565  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2149  xylose isomerase domain-containing protein  36.6 
 
 		 271 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.398235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3240  xylose isomerase domain-containing protein  36.98 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2603  xylose isomerase domain protein TIM barrel  36.6 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0698398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30200  Xylose isomerase-type TIM-barrel protein  36.98 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3122  xylose isomerase domain-containing protein  36.6 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6104  xylose isomerase domain-containing protein  36.12 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3810  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  40.94 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022666  normal  0.0930685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2673  xylose isomerase domain-containing protein  36.93 
 
 		 287 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2191  sugar phosphate isomerases/epimerases  33.58 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4909  xylose isomerase-like TIM barrel  33.21 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.64 
 
 		 269 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0783  xylose isomerase-like TIM barrel  36.95 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2699  xylose isomerase domain-containing protein  35.77 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.254699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2346  xylose isomerase domain-containing protein  38.43 
 
 		 276 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2702  xylose isomerase domain-containing protein  34.08 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.964957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2843  xylose isomerase domain-containing protein  34.94 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1216  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5912  xylose isomerase domain-containing protein  36.6 
 
 		 275 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2156  decreased coverage  0.00155667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02960  hypothetical protein  35.09 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.92 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1590  xylose isomerase-like TIM barrel  37.26 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3491  xylose isomerase domain-containing protein  32.84 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3684  xylose isomerase domain-containing protein  33.94 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.414118  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1392  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.95 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7150  xylose isomerase domain-containing protein  30.92 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0134  xylose isomerase domain-containing protein  34.3 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3481  xylose isomerase domain-containing protein  30.29 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3640  xylose isomerase domain-containing protein  35.83 
 
 		 288 aa  89  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2254  xylose isomerase domain-containing protein  32.8 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.565091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1496  xylose isomerase domain-containing protein  31.73 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3304  xylose isomerase domain-containing protein  37.74 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6806  xylose isomerase domain-containing protein  30.83 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4305  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.24 
 
 		 628 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.92924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4415  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  28.24 
 
 		 628 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02058  hypothetical protein  29.17 
 
 		 626 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0224521  normal  0.842888 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2157  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.77 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3597  xylose isomerase domain-containing protein  36.57 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.791675  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3326  xylose isomerase domain-containing protein  27.31 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0292  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  27.13 
 
 		 615 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33680  hypothetical protein  28.57 
 
 		 274 aa  50.4  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1099  xylose isomerase domain-containing protein  28.07 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0418  xylose isomerase domain-containing protein  24.54 
 
 		 635 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5035  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.41 
 
 		 632 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03000  hypothetical protein  27.41 
 
 		 634 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3840  xylose isomerase domain-containing protein  31.48 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.479073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0839  xylose isomerase domain-containing protein  27.5 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3692  xylose isomerase domain-containing protein  26.64 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4093  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.61 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.78661  normal  0.012574 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1026  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5449  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  26.57 
 
 		 615 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3320  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25.7 
 
 		 630 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6321  xylose isomerase domain-containing protein  23.43 
 
 		 295 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1508  xylose isomerase-like TIM barrel  23.43 
 
 		 295 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6979  xylose isomerase domain-containing protein  23.43 
 
 		 295 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4567  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 627 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5952  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  25 
 
 		 631 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0955687  decreased coverage  0.00791612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>