63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3526 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3526  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  176  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000345373  unclonable  0.00000321794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 
287 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
275 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  43.64 
 
 
275 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
283 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  39.13 
 
 
279 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  38.71 
 
 
275 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
283 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  36.36 
 
 
283 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
283 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 
275 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
283 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
283 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
284 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  52.78 
 
 
254 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
283 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
283 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 
277 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  40.38 
 
 
287 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  36.36 
 
 
285 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  38.3 
 
 
266 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  42 
 
 
287 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  41.67 
 
 
314 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  39.58 
 
 
283 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  38.64 
 
 
269 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
266 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  42 
 
 
394 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 
270 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  48.57 
 
 
263 aa  42.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 
267 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  40.91 
 
 
279 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  37.84 
 
 
260 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 
283 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  40.91 
 
 
286 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  38.64 
 
 
258 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  36.17 
 
 
289 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
277 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  36.17 
 
 
289 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  46.67 
 
 
259 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  47.22 
 
 
258 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 
275 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  41.46 
 
 
258 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1886  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
284 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  43.9 
 
 
258 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 
271 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 
293 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
263 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  43.24 
 
 
269 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  34.04 
 
 
290 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  37.78 
 
 
233 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 
280 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 
297 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  37.25 
 
 
380 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  36.36 
 
 
286 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  38.64 
 
 
284 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
294 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  35.56 
 
 
233 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 
291 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  47.22 
 
 
257 aa  40  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  44.44 
 
 
257 aa  40.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
425 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  39.58 
 
 
271 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>