More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1036 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  100 
 
 		 234 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  70.18 
 
 		 229 aa  297  7e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  60.09 
 
 		 236 aa  271  7e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  56.44 
 
 		 235 aa  254  6e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  56.65 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  51.07 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  45.07 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  49.36 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  49.11 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  48.31 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  48.4 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  47.37 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  49.55 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  43.36 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  43.46 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  42.86 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  43.75 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  40.72 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  41.47 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  38.91 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  36.56 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  42.77 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  38.66 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  35.61 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  35.96 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  41.87 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  38.04 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  36.77 
 
 		 217 aa  100  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  30 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  27.9 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  30.58 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  30.17 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  29.74 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  30.16 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  31.36 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  30.89 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  31.34 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2438  uridylate kinase  31.17 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139798  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  31.34 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  33.17 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  27.35 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  31.34 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  29.22 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  29.22 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  28.57 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2855  uridylate kinase  29.96 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654259  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  26.86 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4151  uridylate kinase  31.02 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0537318  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  28.88 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1117  uridylate kinase  32.53 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  29.22 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  28.45 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  30.71 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  30.52 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1160  uridylate kinase  32.53 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  28.88 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  29.75 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  31.37 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  32.14 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  27.35 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  26.97 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  29.5 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  28.57 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  29.55 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  30.71 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  29.46 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  27.8 
 
 		 237 aa  72  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  28.28 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2826  uridylate kinase  29.75 
 
 		 238 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  33.51 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  28.4 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  32.11 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  32.42 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1383  uridylate kinase  34.92 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.862612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  29.76 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2031  uridylate kinase  31.93 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  30.04 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  34.04 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2524  uridylate kinase  30.21 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831867  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  30.33 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  30.33 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  30.33 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  27.64 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  30.33 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  30.33 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  30.33 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  30.33 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0444  uridylate kinase  26.61 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.014483  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  25.71 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  29.63 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  25.4 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1133  uridylate kinase  29.32 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  27.82 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  31.18 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  30.17 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  27.78 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  30.17 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  30.04 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3266  uridylate kinase  29.55 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  26.61 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>