More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1804 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  72.22 
 
 		 217 aa  315  2e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  75.93 
 
 		 217 aa  300  1e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  72.22 
 
 		 217 aa  291  5e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  42.6 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  43.89 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  41.01 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  39.55 
 
 		 227 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  38.97 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  35.81 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  36.54 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  35.61 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  35 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  36.28 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  36.55 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  38.39 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  36.55 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  36.45 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  36.63 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  34.78 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  37.11 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  32.43 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  34.33 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  32.02 
 
 		 225 aa  99.4  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  32.06 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  37.5 
 
 		 241 aa  96.3  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  37 
 
 		 242 aa  95.1  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  34.5 
 
 		 241 aa  88.2  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  33.17 
 
 		 239 aa  86.3  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  27.35 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  26.23 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3266  uridylate kinase  28.57 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  28.64 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  27.91 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  27.31 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  28.5 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0527  uridylate kinase  28.05 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  26.39 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  27.8 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  30.7 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  27.23 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  25.93 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  25.93 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  25.93 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  30.22 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  28.22 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  27.73 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  25.93 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  30.7 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  25.93 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1842  uridylate kinase  33.16 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  25.46 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  25.93 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  25.46 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  25.46 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  28.64 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  25.46 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  25.46 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2826  uridylate kinase  28.57 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2855  uridylate kinase  28.57 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654259  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  25.46 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  25.46 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  25.93 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  25.46 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  26.44 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  27.31 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  26.76 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  30.57 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  27.6 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  28.86 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  28.83 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2438  uridylate kinase  27.92 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139798  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  28.02 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  27.27 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  26.69 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  28.21 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf053  uridylate kinase  29.28 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  24.54 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  31.19 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  30.45 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4124  uridylate kinase  30.41 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13319  predicted protein  27.43 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.494059  normal  0.0799913 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  31.65 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0444  uridylate kinase  27.27 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.014483  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  28.44 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  24.54 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  24.54 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  24.79 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  24.79 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  28.84 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  26.85 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  28.72 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  26.36 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  28.22 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  29.41 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  28.29 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  27.5 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  26.54 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  28.72 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  27.59 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>