More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0444 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0444  uridylate kinase  100 
 
 		 235 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.014483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  74.79 
 
 		 235 aa  368  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  66.67 
 
 		 237 aa  329  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  64.53 
 
 		 239 aa  312  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  62.39 
 
 		 237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  61.97 
 
 		 237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  59.92 
 
 		 240 aa  299  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  62.71 
 
 		 242 aa  298  6e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  59.07 
 
 		 240 aa  296  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  59.92 
 
 		 240 aa  294  8e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  59.49 
 
 		 241 aa  291  4e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  61.8 
 
 		 253 aa  291  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  61.64 
 
 		 239 aa  289  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  58.65 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  58.05 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  59.75 
 
 		 238 aa  288  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  58.37 
 
 		 240 aa  288  7e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  59.32 
 
 		 242 aa  288  7e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  58.37 
 
 		 240 aa  288  7e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  58.8 
 
 		 240 aa  287  9e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  62.71 
 
 		 240 aa  285  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  59.74 
 
 		 238 aa  285  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  58.65 
 
 		 244 aa  285  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  57.63 
 
 		 239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  57.45 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  58.55 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  55.7 
 
 		 238 aa  277  8e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  54.66 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  55.36 
 
 		 236 aa  276  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  54.66 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  54.43 
 
 		 240 aa  275  6e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  54.24 
 
 		 240 aa  274  8e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0646  uridylate kinase  56.28 
 
 		 238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  56.9 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  56.9 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  56.9 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  55.27 
 
 		 241 aa  271  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  55.36 
 
 		 237 aa  271  5.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  52.54 
 
 		 239 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2477  uridylate kinase  59.07 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000191921  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  56.22 
 
 		 237 aa  271  9e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  55.93 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3923  uridylate kinase  59.07 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0560874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3866  uridylate kinase  59.07 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0152776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3676  uridylate kinase  59.07 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3566  uridylate kinase  59.07 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.077346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3584  uridylate kinase  59.07 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3872  uridylate kinase  59.07 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000594608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  56.71 
 
 		 239 aa  269  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3963  uridylate kinase  59.07 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0920824  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  54.85 
 
 		 241 aa  269  2e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1320  uridylate kinase  59.07 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017232  hitchhiker  2.23199e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3837  uridylate kinase  59.07 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.33884e-62 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  54.24 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  55.84 
 
 		 244 aa  269  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  55.36 
 
 		 235 aa  268  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0977  uridylate kinase  56.9 
 
 		 243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111069  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  54.94 
 
 		 236 aa  267  8.999999999999999e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  54.51 
 
 		 253 aa  267  8.999999999999999e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  54.51 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  54.51 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  54.08 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  52.36 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  52.14 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  54.04 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  54.43 
 
 		 241 aa  265  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3648  uridylate kinase  58.23 
 
 		 240 aa  265  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  52.99 
 
 		 241 aa  264  8e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  55.41 
 
 		 242 aa  264  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  53.22 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  51.69 
 
 		 239 aa  263  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  53.59 
 
 		 245 aa  263  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  51.93 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  50.85 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  53.65 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  51.71 
 
 		 234 aa  261  6e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  52.81 
 
 		 245 aa  261  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  52.32 
 
 		 248 aa  261  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  54.08 
 
 		 234 aa  261  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0259  uridylate kinase  56.54 
 
 		 239 aa  261  8.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  54.55 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  55.98 
 
 		 239 aa  260  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  52.79 
 
 		 237 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  53.65 
 
 		 234 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13319  predicted protein  52.86 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.494059  normal  0.0799913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  54.98 
 
 		 249 aa  258  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  54.08 
 
 		 234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  51.9 
 
 		 243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  53.22 
 
 		 240 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  54.08 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  52.79 
 
 		 240 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  50.43 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  50 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  53.65 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  49.57 
 
 		 235 aa  256  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  51.5 
 
 		 235 aa  255  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  52.12 
 
 		 274 aa  255  4e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  49.78 
 
 		 246 aa  255  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  49.15 
 
 		 241 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  49.15 
 
 		 241 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>