More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1319 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  100 
 
 
241 aa  496  1e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  60.52 
 
 
242 aa  287  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  58.55 
 
 
242 aa  285  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  59.83 
 
 
237 aa  284  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  59.23 
 
 
237 aa  284  7e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  59.23 
 
 
237 aa  284  7e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  60.09 
 
 
242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  60.34 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  58.72 
 
 
234 aa  282  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  59.48 
 
 
240 aa  281  7.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  58.37 
 
 
244 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  58.12 
 
 
234 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  58.8 
 
 
234 aa  279  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  59.66 
 
 
253 aa  279  4e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  56.07 
 
 
241 aa  278  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  59.91 
 
 
237 aa  277  1e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  57.08 
 
 
240 aa  276  2e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  57.2 
 
 
248 aa  276  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  57.45 
 
 
234 aa  275  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  57.51 
 
 
242 aa  275  5e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  57.45 
 
 
253 aa  273  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  57.2 
 
 
243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  55.98 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  56.54 
 
 
249 aa  272  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  57.26 
 
 
240 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  57.33 
 
 
238 aa  271  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  56.03 
 
 
251 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  56.03 
 
 
251 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  56.03 
 
 
251 aa  271  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  57.38 
 
 
237 aa  270  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  56.84 
 
 
245 aa  270  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  56.65 
 
 
239 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  55.98 
 
 
235 aa  269  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  55.98 
 
 
237 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  57.51 
 
 
234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  55.79 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  55.79 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  55.17 
 
 
239 aa  268  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  56.6 
 
 
240 aa  268  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  55.56 
 
 
240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  55.56 
 
 
240 aa  268  7e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  53.65 
 
 
240 aa  267  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  55.13 
 
 
241 aa  265  4e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  52.28 
 
 
245 aa  265  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  55.32 
 
 
240 aa  265  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1163  uridylate kinase  56.41 
 
 
265 aa  264  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  56.78 
 
 
242 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  55.17 
 
 
236 aa  263  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  57.45 
 
 
244 aa  263  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  55.51 
 
 
241 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  55.51 
 
 
241 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  53.65 
 
 
241 aa  263  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  54.7 
 
 
239 aa  262  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  54.7 
 
 
245 aa  262  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  54.47 
 
 
239 aa  262  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  54.66 
 
 
274 aa  261  8e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  54.43 
 
 
244 aa  260  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0527  uridylate kinase  52.97 
 
 
246 aa  259  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105771  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  54.39 
 
 
243 aa  259  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  55.27 
 
 
250 aa  260  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  54.24 
 
 
242 aa  259  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  55.79 
 
 
237 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  55.51 
 
 
238 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  55.36 
 
 
237 aa  258  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  55.36 
 
 
237 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  55.36 
 
 
237 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  55.36 
 
 
237 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  55.13 
 
 
239 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  52.99 
 
 
234 aa  258  7e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  55.36 
 
 
237 aa  258  7e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  57.69 
 
 
238 aa  258  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  54.94 
 
 
237 aa  257  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  53.85 
 
 
251 aa  257  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  55.08 
 
 
238 aa  257  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  51.04 
 
 
242 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  53.42 
 
 
241 aa  257  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  53.65 
 
 
239 aa  257  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  56.17 
 
 
266 aa  257  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0259  uridylate kinase  56.12 
 
 
239 aa  256  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  55.13 
 
 
239 aa  256  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  52.32 
 
 
240 aa  256  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  54.7 
 
 
236 aa  255  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  54.7 
 
 
236 aa  255  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  54.7 
 
 
236 aa  255  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  55.36 
 
 
237 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  54.94 
 
 
237 aa  255  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  54.2 
 
 
258 aa  255  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  51.05 
 
 
242 aa  255  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  55.36 
 
 
237 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  54.66 
 
 
255 aa  255  5e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  54.94 
 
 
237 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  54.94 
 
 
237 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  54.94 
 
 
237 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  54.94 
 
 
237 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  54.94 
 
 
237 aa  255  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  54.94 
 
 
237 aa  255  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  53.85 
 
 
236 aa  255  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  50.21 
 
 
246 aa  254  6e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  55.36 
 
 
237 aa  254  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  53.78 
 
 
239 aa  254  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>