More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1437 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  100 
 
 
258 aa  521  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  98.31 
 
 
236 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  97.46 
 
 
236 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  97.03 
 
 
236 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  97.03 
 
 
236 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  93.16 
 
 
237 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  92.74 
 
 
237 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  93.16 
 
 
237 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  92.41 
 
 
237 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  92.83 
 
 
237 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  93.16 
 
 
237 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  92.41 
 
 
237 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  93.16 
 
 
237 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  91.56 
 
 
237 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  91.56 
 
 
237 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  91.88 
 
 
237 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  91.56 
 
 
237 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  91.56 
 
 
237 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  92.74 
 
 
237 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  92.74 
 
 
237 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  91.56 
 
 
237 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  91.56 
 
 
237 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  91.25 
 
 
286 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  81.36 
 
 
236 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  80.51 
 
 
236 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  80.51 
 
 
236 aa  394  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  79.24 
 
 
236 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  81.36 
 
 
236 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  78.99 
 
 
240 aa  390  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  80.08 
 
 
236 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  79.91 
 
 
240 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  79.06 
 
 
240 aa  388  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  79.91 
 
 
240 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  78.21 
 
 
240 aa  384  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  78.3 
 
 
240 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  77.31 
 
 
240 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  76.17 
 
 
238 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  77.12 
 
 
238 aa  371  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2176  uridylate kinase  81.12 
 
 
237 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  74.79 
 
 
238 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  64.81 
 
 
241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  64.81 
 
 
241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  61.21 
 
 
239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  61.18 
 
 
239 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  61.37 
 
 
249 aa  301  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  60.17 
 
 
251 aa  301  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  60.17 
 
 
251 aa  301  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  60.34 
 
 
238 aa  301  9e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  60.17 
 
 
251 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  61.11 
 
 
239 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  60.34 
 
 
242 aa  299  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  60.68 
 
 
239 aa  299  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  60.94 
 
 
240 aa  297  9e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  60.52 
 
 
240 aa  297  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  60.68 
 
 
241 aa  295  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  58.55 
 
 
245 aa  296  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  60.26 
 
 
246 aa  294  8e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  57.2 
 
 
253 aa  294  9e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  58.12 
 
 
237 aa  290  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  61.14 
 
 
261 aa  290  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  59.57 
 
 
236 aa  290  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  56.28 
 
 
242 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  57.98 
 
 
240 aa  288  8e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  61.04 
 
 
240 aa  288  9e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  59.91 
 
 
240 aa  286  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  57.08 
 
 
237 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  56.71 
 
 
242 aa  286  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  56.28 
 
 
242 aa  285  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  57.45 
 
 
240 aa  285  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  55.79 
 
 
235 aa  285  4e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0787  uridylate kinase  63.68 
 
 
237 aa  285  5e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  56.03 
 
 
234 aa  284  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  59.49 
 
 
245 aa  284  9e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  55.17 
 
 
237 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  56.47 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  56.47 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  57.26 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  55.41 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  57.87 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  59.4 
 
 
239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  58.23 
 
 
244 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  56.02 
 
 
247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  58.97 
 
 
239 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0709  uridylate kinase  57.51 
 
 
241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  57.87 
 
 
242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  56.9 
 
 
235 aa  282  4.0000000000000003e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  57.58 
 
 
240 aa  281  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  57.51 
 
 
244 aa  281  5.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  56.65 
 
 
241 aa  281  8.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  54.94 
 
 
234 aa  281  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  55.17 
 
 
234 aa  281  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  59.48 
 
 
239 aa  281  9e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0243  uridylate kinase  57.08 
 
 
241 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  56.02 
 
 
247 aa  280  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0240  uridylate kinase  57.08 
 
 
241 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351644  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0256  uridylate kinase  57.08 
 
 
241 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0258  uridylate kinase  57.08 
 
 
241 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  55.17 
 
 
234 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0240  uridylate kinase  57.08 
 
 
241 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.432338 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  56.6 
 
 
236 aa  280  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>