More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10930 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  100 
 
 
240 aa  491  9.999999999999999e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  74.47 
 
 
240 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  72.1 
 
 
238 aa  354  5.999999999999999e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  66.81 
 
 
251 aa  344  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  66.81 
 
 
251 aa  344  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  67.24 
 
 
251 aa  343  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  67.97 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  62.71 
 
 
239 aa  333  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  64.94 
 
 
242 aa  328  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  65.8 
 
 
253 aa  325  3e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  65.4 
 
 
274 aa  324  7e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  64.66 
 
 
241 aa  323  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  65.37 
 
 
240 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  64.94 
 
 
240 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  64.5 
 
 
240 aa  322  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  63.09 
 
 
237 aa  322  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  66.38 
 
 
242 aa  322  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  63.09 
 
 
237 aa  322  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  61.44 
 
 
239 aa  321  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  63.64 
 
 
239 aa  320  9.000000000000001e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  63.25 
 
 
237 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  64.07 
 
 
239 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  64.66 
 
 
239 aa  318  7e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  64.5 
 
 
236 aa  317  7.999999999999999e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  62.5 
 
 
242 aa  317  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  61.44 
 
 
242 aa  317  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  63.71 
 
 
240 aa  316  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  60.76 
 
 
239 aa  316  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  63.79 
 
 
240 aa  315  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  63.09 
 
 
237 aa  315  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  61.18 
 
 
241 aa  315  6e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  61.02 
 
 
240 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  61.18 
 
 
240 aa  313  9.999999999999999e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  61.6 
 
 
240 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  64.56 
 
 
239 aa  313  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  61.64 
 
 
242 aa  313  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  60.59 
 
 
240 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  61.64 
 
 
234 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  61.28 
 
 
239 aa  312  3.9999999999999997e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  61.64 
 
 
234 aa  311  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  62.34 
 
 
237 aa  310  1e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  61.44 
 
 
241 aa  310  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  61.44 
 
 
241 aa  310  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  59.74 
 
 
244 aa  308  5e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  61.21 
 
 
234 aa  307  8e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  62.13 
 
 
253 aa  307  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  60.34 
 
 
234 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  57.94 
 
 
235 aa  305  5.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  58.8 
 
 
237 aa  305  6e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  60.92 
 
 
241 aa  305  6e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  60.78 
 
 
241 aa  304  9.000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  61.18 
 
 
239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  63.14 
 
 
238 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  61.97 
 
 
236 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  61.54 
 
 
240 aa  301  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  61.54 
 
 
240 aa  301  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  61.11 
 
 
240 aa  300  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  61.11 
 
 
255 aa  300  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  58.05 
 
 
235 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  60.34 
 
 
237 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  60.76 
 
 
237 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  57.81 
 
 
239 aa  300  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  57.94 
 
 
235 aa  299  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  58.37 
 
 
237 aa  299  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  58.65 
 
 
238 aa  299  3e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  60.34 
 
 
237 aa  298  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  57.26 
 
 
235 aa  297  1e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  58.55 
 
 
239 aa  297  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  61.47 
 
 
238 aa  296  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  58.97 
 
 
239 aa  296  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  59.41 
 
 
241 aa  296  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  58.87 
 
 
245 aa  296  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  58.58 
 
 
241 aa  296  2e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  62.29 
 
 
240 aa  296  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  59.31 
 
 
246 aa  295  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  55.56 
 
 
235 aa  293  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  59 
 
 
241 aa  293  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  58.8 
 
 
244 aa  293  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  58.55 
 
 
236 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  59.23 
 
 
245 aa  292  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  56.22 
 
 
235 aa  291  5e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  58.58 
 
 
243 aa  291  9e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  59.66 
 
 
243 aa  290  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2477  uridylate kinase  62.03 
 
 
240 aa  289  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000191921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  61.47 
 
 
236 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  58.47 
 
 
241 aa  290  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  61.04 
 
 
237 aa  289  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  60.78 
 
 
245 aa  289  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3923  uridylate kinase  61.18 
 
 
240 aa  289  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0560874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  58.23 
 
 
251 aa  289  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  58.01 
 
 
236 aa  289  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  59.48 
 
 
246 aa  289  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3866  uridylate kinase  61.18 
 
 
240 aa  288  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0152776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3676  uridylate kinase  61.18 
 
 
240 aa  288  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3566  uridylate kinase  61.18 
 
 
240 aa  288  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.077346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3584  uridylate kinase  61.18 
 
 
240 aa  288  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3872  uridylate kinase  61.18 
 
 
240 aa  288  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000594608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3963  uridylate kinase  61.18 
 
 
240 aa  288  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0920824  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  59.05 
 
 
242 aa  288  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3837  uridylate kinase  61.18 
 
 
240 aa  288  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.33884e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>