More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1464 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  76.27 
 
 		 242 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  68.22 
 
 		 242 aa  340  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  67.52 
 
 		 245 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  66.52 
 
 		 243 aa  331  7.000000000000001e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  62.66 
 
 		 246 aa  319  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  66.53 
 
 		 239 aa  315  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  65.37 
 
 		 240 aa  314  8e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  66.09 
 
 		 241 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  66.09 
 
 		 241 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  62.77 
 
 		 243 aa  308  4e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  62.34 
 
 		 243 aa  305  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  62.29 
 
 		 240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  61.86 
 
 		 240 aa  304  8.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  64.41 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  61.18 
 
 		 239 aa  301  8.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  61.41 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  61.25 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  61.25 
 
 		 251 aa  299  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  61.25 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  61.02 
 
 		 239 aa  298  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  62.66 
 
 		 239 aa  297  9e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  62.55 
 
 		 238 aa  296  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  61.21 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  60.26 
 
 		 236 aa  295  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  62.23 
 
 		 249 aa  295  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  61.8 
 
 		 239 aa  295  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  59.83 
 
 		 236 aa  294  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  59.83 
 
 		 236 aa  294  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  60.26 
 
 		 258 aa  294  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  60.61 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  61.04 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  60.68 
 
 		 236 aa  293  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  60.26 
 
 		 236 aa  292  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  58.75 
 
 		 241 aa  292  4e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  58.97 
 
 		 236 aa  291  5e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  58.9 
 
 		 245 aa  291  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  58.72 
 
 		 238 aa  291  5e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  59.4 
 
 		 236 aa  291  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  58.8 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  58.9 
 
 		 247 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  60.68 
 
 		 236 aa  291  8e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  58.9 
 
 		 245 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  60.26 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  59.4 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  60.61 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  59.31 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  57.33 
 
 		 235 aa  290  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  58.97 
 
 		 236 aa  290  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  59.15 
 
 		 286 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  58.97 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  59.74 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  59.48 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  59.74 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  58.87 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  58.47 
 
 		 247 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  59.15 
 
 		 237 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  59.15 
 
 		 237 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  60.17 
 
 		 237 aa  288  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  59.15 
 
 		 237 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  59.15 
 
 		 237 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  59.15 
 
 		 237 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  58.47 
 
 		 247 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  60.17 
 
 		 237 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  58.97 
 
 		 239 aa  288  4e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  59.15 
 
 		 237 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  60.17 
 
 		 237 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  60.17 
 
 		 237 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  59.23 
 
 		 240 aa  289  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  58.62 
 
 		 274 aa  288  5.0000000000000004e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  59.4 
 
 		 236 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  58.8 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  58.8 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  58.37 
 
 		 240 aa  288  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  59.31 
 
 		 237 aa  288  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  60.52 
 
 		 240 aa  287  9e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  59.15 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  59.05 
 
 		 247 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  59.05 
 
 		 246 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  59.66 
 
 		 240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  58.72 
 
 		 237 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  59.66 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  56.84 
 
 		 239 aa  285  5e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  61.37 
 
 		 245 aa  285  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  58.62 
 
 		 247 aa  284  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  58.12 
 
 		 236 aa  284  8e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  58.3 
 
 		 237 aa  284  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  55.6 
 
 		 235 aa  284  9e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  58.62 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  59.83 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  58.37 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  58.12 
 
 		 236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  57.14 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  59.05 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  58.19 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  58.37 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  62.67 
 
 		 246 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  58.62 
 
 		 235 aa  281  7.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  58.8 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  57.14 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>