More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0332 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  100 
 
 
243 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  99.18 
 
 
243 aa  487  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  84.58 
 
 
240 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  82.08 
 
 
242 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  65.24 
 
 
242 aa  320  9.000000000000001e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  65.81 
 
 
243 aa  318  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  63.71 
 
 
242 aa  318  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  63.14 
 
 
239 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  62.66 
 
 
245 aa  308  6.999999999999999e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  61.47 
 
 
246 aa  306  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  62.34 
 
 
246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  57.92 
 
 
274 aa  298  6e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  57.81 
 
 
241 aa  294  9e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  57.81 
 
 
241 aa  294  9e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  59.92 
 
 
239 aa  292  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  60.08 
 
 
240 aa  291  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  59.66 
 
 
240 aa  291  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  58.9 
 
 
241 aa  291  7e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  57.38 
 
 
239 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  56.84 
 
 
235 aa  289  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  59.49 
 
 
239 aa  289  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  57.38 
 
 
239 aa  289  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  60.43 
 
 
239 aa  286  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  57.87 
 
 
251 aa  286  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  57.87 
 
 
251 aa  286  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  59.05 
 
 
237 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  58.12 
 
 
251 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  59.05 
 
 
237 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  59.05 
 
 
237 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  59.05 
 
 
237 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  58.62 
 
 
237 aa  285  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  58.55 
 
 
249 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  59.66 
 
 
246 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  59.05 
 
 
237 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  59.66 
 
 
247 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  59.91 
 
 
242 aa  285  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  58.19 
 
 
237 aa  284  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  58.19 
 
 
286 aa  284  7e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  58.19 
 
 
237 aa  284  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  58.19 
 
 
237 aa  284  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  58.19 
 
 
237 aa  284  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  58.62 
 
 
237 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  58.19 
 
 
237 aa  284  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  58.19 
 
 
237 aa  284  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  58.19 
 
 
237 aa  284  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  59.66 
 
 
249 aa  283  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  58.62 
 
 
237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  56.41 
 
 
235 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  58.62 
 
 
237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  58.62 
 
 
237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  56.41 
 
 
236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  59.66 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  55.7 
 
 
239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  58.56 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  59.23 
 
 
247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  56.6 
 
 
235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  56.96 
 
 
239 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  59.66 
 
 
244 aa  281  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0565  uridylate kinase  57.69 
 
 
253 aa  281  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  57.76 
 
 
240 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  57.38 
 
 
247 aa  281  9e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  57.87 
 
 
247 aa  280  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  58.58 
 
 
239 aa  280  1e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  58.87 
 
 
238 aa  280  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  58.8 
 
 
247 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  58.37 
 
 
245 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  59.23 
 
 
247 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  59.23 
 
 
247 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  55.79 
 
 
235 aa  279  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  56.12 
 
 
239 aa  279  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  55.93 
 
 
246 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  56.22 
 
 
235 aa  279  3e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  55.36 
 
 
240 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  59.23 
 
 
247 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  56.71 
 
 
243 aa  278  4e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  57.45 
 
 
241 aa  278  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  56.49 
 
 
243 aa  278  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  58.37 
 
 
245 aa  278  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  55.51 
 
 
246 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  57.02 
 
 
241 aa  278  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  55.51 
 
 
246 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  57.02 
 
 
241 aa  278  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  57.33 
 
 
240 aa  278  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  55.32 
 
 
247 aa  278  8e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  55.32 
 
 
247 aa  277  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  53.94 
 
 
245 aa  277  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  57.63 
 
 
239 aa  277  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  56.65 
 
 
249 aa  277  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  55.93 
 
 
240 aa  277  1e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  54.94 
 
 
240 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  58.87 
 
 
245 aa  277  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2974  uridylate kinase  56.12 
 
 
249 aa  276  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  56.03 
 
 
236 aa  276  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  54.89 
 
 
237 aa  276  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  54.58 
 
 
245 aa  276  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  55.88 
 
 
242 aa  276  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  57.94 
 
 
236 aa  276  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  56.28 
 
 
236 aa  275  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  54.98 
 
 
244 aa  276  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  55.04 
 
 
245 aa  276  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>