More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2705 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  100 
 
 		 246 aa  507  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  99.59 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  99.19 
 
 		 246 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3993  uridylate kinase  85.66 
 
 		 244 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.927712  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  85.95 
 
 		 243 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  84.45 
 
 		 249 aa  420  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1414  uridylate kinase  79.27 
 
 		 249 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  65.8 
 
 		 246 aa  321  8e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  67.25 
 
 		 241 aa  319  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  65.09 
 
 		 245 aa  318  5e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  60.74 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  64.22 
 
 		 244 aa  308  5e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  60.98 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  60.66 
 
 		 246 aa  304  9.000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  63.68 
 
 		 239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  62.82 
 
 		 237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  63.48 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  61.21 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  61.21 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  66.51 
 
 		 237 aa  295  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  63.79 
 
 		 240 aa  294  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  63.36 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  61.37 
 
 		 239 aa  291  7e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0266  uridylate kinase  56.79 
 
 		 244 aa  291  8e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  57.76 
 
 		 237 aa  291  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  58.23 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  60.34 
 
 		 239 aa  289  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  60.94 
 
 		 239 aa  289  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  55.98 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  55.98 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  60.94 
 
 		 239 aa  289  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  59.05 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  58.2 
 
 		 251 aa  288  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  59.23 
 
 		 237 aa  289  4e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  58.2 
 
 		 251 aa  288  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  57.38 
 
 		 240 aa  288  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  58.37 
 
 		 244 aa  288  8e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  58.2 
 
 		 251 aa  287  9e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  60.34 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  57.55 
 
 		 242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  61.37 
 
 		 238 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  56.9 
 
 		 253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  60.52 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  59.92 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  57.51 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  60.34 
 
 		 238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  54.27 
 
 		 236 aa  281  5.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  58.55 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  56.83 
 
 		 234 aa  281  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  58.2 
 
 		 249 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  58.19 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  58.19 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  58.19 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  55.93 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  58.19 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0759  uridylate kinase  53.88 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  55.93 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  57.58 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  59.66 
 
 		 239 aa  278  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  57.69 
 
 		 241 aa  279  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  57.76 
 
 		 237 aa  279  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  57.33 
 
 		 237 aa  278  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  54.55 
 
 		 244 aa  278  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  56.84 
 
 		 241 aa  278  5e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  55.95 
 
 		 234 aa  278  5e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  55.6 
 
 		 235 aa  278  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  57.33 
 
 		 237 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  57.33 
 
 		 237 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  57.33 
 
 		 237 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  57.33 
 
 		 237 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  57.33 
 
 		 237 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  57.33 
 
 		 237 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  59.31 
 
 		 246 aa  278  6e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  57.33 
 
 		 286 aa  277  9e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  58.19 
 
 		 237 aa  277  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  55.6 
 
 		 274 aa  277  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  58.37 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  58.19 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  57.69 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  57.33 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  53.45 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  57.33 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  57.33 
 
 		 236 aa  276  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  55.95 
 
 		 234 aa  275  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  58.15 
 
 		 236 aa  275  4e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  56.47 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  54.47 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  55.74 
 
 		 240 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  55.79 
 
 		 236 aa  275  7e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  56 
 
 		 234 aa  274  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  55.13 
 
 		 242 aa  274  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  56.44 
 
 		 237 aa  274  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  57.14 
 
 		 240 aa  274  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  53.02 
 
 		 235 aa  274  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  55.98 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  55.98 
 
 		 239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  56.28 
 
 		 238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  54.47 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  57.63 
 
 		 237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  56 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>