More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1493 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  100 
 
 		 243 aa  503  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  86.36 
 
 		 246 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  86.36 
 
 		 246 aa  427  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  85.95 
 
 		 246 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3993  uridylate kinase  87.93 
 
 		 244 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.927712  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  85.34 
 
 		 249 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1414  uridylate kinase  84.55 
 
 		 249 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  66.95 
 
 		 241 aa  328  7e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  65.24 
 
 		 241 aa  319  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  62.18 
 
 		 245 aa  311  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  62.71 
 
 		 250 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  63.52 
 
 		 246 aa  309  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  63.95 
 
 		 244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  61.09 
 
 		 263 aa  305  4.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  61.11 
 
 		 237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0266  uridylate kinase  57.44 
 
 		 244 aa  298  4e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  63.52 
 
 		 237 aa  298  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  62.23 
 
 		 239 aa  298  6e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  62.67 
 
 		 241 aa  296  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  62.67 
 
 		 241 aa  296  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  62.13 
 
 		 238 aa  296  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  61.78 
 
 		 237 aa  295  5e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  60.78 
 
 		 239 aa  294  8e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  60.52 
 
 		 239 aa  291  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  59.4 
 
 		 237 aa  292  4e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  60.85 
 
 		 238 aa  292  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  60.17 
 
 		 246 aa  291  8e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  61.09 
 
 		 240 aa  291  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  60.67 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  57.08 
 
 		 237 aa  289  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  57.08 
 
 		 237 aa  289  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0759  uridylate kinase  57.63 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  59.23 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  58.16 
 
 		 274 aa  289  3e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  59.66 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  59.57 
 
 		 238 aa  287  9e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  56.72 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  59.57 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  56.72 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  57.76 
 
 		 251 aa  285  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0530  uridylate kinase  58.12 
 
 		 247 aa  285  5e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  59.05 
 
 		 239 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  57.76 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  55.56 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  60.34 
 
 		 237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  56.65 
 
 		 237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  58.8 
 
 		 237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  58.8 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  57.45 
 
 		 239 aa  282  3.0000000000000004e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  57.08 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  54.27 
 
 		 236 aa  281  5.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  57.76 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  55.7 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  57.56 
 
 		 249 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  55.36 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  57.76 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  56.47 
 
 		 245 aa  280  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  59.23 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  56.65 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  55.79 
 
 		 235 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  56.17 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  56.71 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  57.76 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  55.74 
 
 		 238 aa  279  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  57.76 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  57.76 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  57.14 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  57.76 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  56.71 
 
 		 243 aa  278  4e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  56.54 
 
 		 286 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  53.42 
 
 		 235 aa  278  4e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  58.01 
 
 		 253 aa  278  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  56.6 
 
 		 237 aa  278  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  53.65 
 
 		 235 aa  278  5e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  56.6 
 
 		 242 aa  278  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  56.78 
 
 		 238 aa  278  6e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  57.33 
 
 		 237 aa  278  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  56.96 
 
 		 237 aa  277  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  56.96 
 
 		 237 aa  277  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  56.96 
 
 		 237 aa  277  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  56.96 
 
 		 237 aa  277  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  56.96 
 
 		 237 aa  277  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  56.96 
 
 		 237 aa  277  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  57.33 
 
 		 235 aa  277  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  57.69 
 
 		 237 aa  276  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  57.69 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  58.01 
 
 		 236 aa  276  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  56.6 
 
 		 237 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  56.6 
 
 		 237 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  54.74 
 
 		 234 aa  275  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  57.26 
 
 		 237 aa  275  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  58.19 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  55.98 
 
 		 242 aa  275  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  56.9 
 
 		 242 aa  275  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  57.33 
 
 		 239 aa  275  7e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  54.94 
 
 		 235 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  53.65 
 
 		 235 aa  274  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  54.66 
 
 		 238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  56.03 
 
 		 239 aa  272  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  55.98 
 
 		 240 aa  273  3e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>