More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2111 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  100 
 
 		 238 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  93.7 
 
 		 238 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  85.71 
 
 		 238 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  77.35 
 
 		 237 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  73.53 
 
 		 239 aa  361  6e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  70.71 
 
 		 239 aa  345  4e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  66.81 
 
 		 239 aa  325  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  67.81 
 
 		 239 aa  322  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  67.38 
 
 		 239 aa  320  9.000000000000001e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  62.98 
 
 		 251 aa  318  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  62.98 
 
 		 251 aa  318  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  63.79 
 
 		 251 aa  318  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  64.71 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  64.29 
 
 		 239 aa  314  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  64.5 
 
 		 249 aa  310  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  63.18 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  63.18 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  63.09 
 
 		 241 aa  304  7e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  61.97 
 
 		 236 aa  303  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  63.03 
 
 		 240 aa  301  6.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  59.57 
 
 		 239 aa  301  7.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  59.83 
 
 		 239 aa  299  3e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  61.64 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  61.64 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  62.03 
 
 		 237 aa  297  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  62.23 
 
 		 239 aa  297  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  61.47 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  61.28 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  62.13 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  59.83 
 
 		 236 aa  295  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  60.5 
 
 		 242 aa  295  6e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  61.37 
 
 		 244 aa  295  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  58.37 
 
 		 245 aa  294  7e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  61.04 
 
 		 237 aa  293  2e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  59.83 
 
 		 239 aa  292  3e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  63.14 
 
 		 238 aa  291  5e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  61.6 
 
 		 237 aa  291  7e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  57.98 
 
 		 240 aa  290  9e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  59.15 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  66.51 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  58.47 
 
 		 240 aa  289  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  61.28 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  59.32 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  61.18 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  58.01 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  57.26 
 
 		 235 aa  289  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  58.01 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  59.15 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  60.52 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  63.72 
 
 		 246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  57.94 
 
 		 234 aa  288  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  58.97 
 
 		 242 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  59.66 
 
 		 245 aa  288  6e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  58.97 
 
 		 242 aa  288  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  57.08 
 
 		 237 aa  287  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  60.17 
 
 		 274 aa  287  8e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  59.15 
 
 		 236 aa  287  9e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  58.19 
 
 		 245 aa  286  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  57.51 
 
 		 234 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  58.58 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  61.02 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  57.26 
 
 		 242 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  59.75 
 
 		 239 aa  285  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  57.32 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  58.47 
 
 		 238 aa  285  5e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  59.07 
 
 		 240 aa  285  5.999999999999999e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  57.94 
 
 		 234 aa  285  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  55.13 
 
 		 236 aa  284  7e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  59.66 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3993  uridylate kinase  60.94 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.927712  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  58.12 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  61.64 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  58.05 
 
 		 244 aa  282  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  65.57 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  59.23 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  58.23 
 
 		 237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  57.51 
 
 		 234 aa  282  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  60.34 
 
 		 246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  59.92 
 
 		 246 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  59.92 
 
 		 246 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  59.17 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  57.74 
 
 		 241 aa  281  7.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  59.31 
 
 		 238 aa  281  8.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  57.14 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  58.05 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  58.01 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  59.91 
 
 		 263 aa  280  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0259  uridylate kinase  62.03 
 
 		 239 aa  279  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  57.92 
 
 		 245 aa  279  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  59.47 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  55.51 
 
 		 238 aa  278  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  56.41 
 
 		 235 aa  278  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  56.41 
 
 		 237 aa  279  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  56.84 
 
 		 235 aa  278  7e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  56.47 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  56.9 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  58.23 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  54.7 
 
 		 235 aa  276  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  55.88 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  57.76 
 
 		 244 aa  275  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>