More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0215 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  100 
 
 		 238 aa  478  1e-134  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  72.15 
 
 		 236 aa  362  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  63.14 
 
 		 235 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  58.05 
 
 		 239 aa  299  3e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  61.28 
 
 		 236 aa  296  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  60 
 
 		 239 aa  291  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  57.51 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  57.51 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  58.37 
 
 		 274 aa  291  6e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  60.78 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  58.72 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  58.3 
 
 		 240 aa  289  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  59.57 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  56.6 
 
 		 246 aa  288  4e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  60.09 
 
 		 251 aa  288  6e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  60.09 
 
 		 251 aa  288  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  62.39 
 
 		 235 aa  288  6e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  60.09 
 
 		 251 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  55.93 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  57.02 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  56.96 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  60.94 
 
 		 239 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  59.15 
 
 		 240 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  60.94 
 
 		 239 aa  285  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  60.09 
 
 		 245 aa  285  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  60.34 
 
 		 249 aa  285  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  55.08 
 
 		 237 aa  285  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  55.08 
 
 		 237 aa  285  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  58.9 
 
 		 235 aa  284  8e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  59.4 
 
 		 235 aa  283  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  60.26 
 
 		 237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  57.87 
 
 		 236 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  57.14 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  56.6 
 
 		 240 aa  282  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  59.83 
 
 		 237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  60.18 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  58.97 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  59.23 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  57.02 
 
 		 235 aa  281  7.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  55.51 
 
 		 237 aa  281  8.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  59.66 
 
 		 241 aa  281  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  54.66 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  56.3 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  56.41 
 
 		 237 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  56.9 
 
 		 244 aa  279  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  54.27 
 
 		 234 aa  279  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  56.96 
 
 		 239 aa  279  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  56.96 
 
 		 239 aa  279  3e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  58.9 
 
 		 240 aa  279  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  58.37 
 
 		 237 aa  278  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  58.65 
 
 		 244 aa  278  8e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  56.17 
 
 		 236 aa  277  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  53.42 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  58.55 
 
 		 239 aa  276  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  56.41 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  56.47 
 
 		 242 aa  276  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  53.85 
 
 		 234 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  53.62 
 
 		 234 aa  275  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  56.36 
 
 		 242 aa  275  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  54.04 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  56.65 
 
 		 245 aa  275  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  56.41 
 
 		 240 aa  275  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  56.41 
 
 		 240 aa  275  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  54.27 
 
 		 240 aa  274  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  56.17 
 
 		 240 aa  275  7e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  58.8 
 
 		 242 aa  274  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  55.17 
 
 		 242 aa  274  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  56.84 
 
 		 240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  54.7 
 
 		 240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  54.66 
 
 		 243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  55.7 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  55.88 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  58.37 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  53.59 
 
 		 239 aa  272  3e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  55.7 
 
 		 238 aa  272  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  55.13 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  54.43 
 
 		 236 aa  272  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  55.08 
 
 		 240 aa  272  3e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  55.79 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  53.85 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  57.2 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  56.65 
 
 		 235 aa  271  6e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  55.36 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4151  uridylate kinase  59.15 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0537318  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  56.36 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  55.56 
 
 		 245 aa  268  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  55.17 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  53.45 
 
 		 237 aa  268  5.9999999999999995e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  54.04 
 
 		 240 aa  268  7e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  55.51 
 
 		 237 aa  267  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  54.47 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  55.56 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  56.77 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  55.74 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  54.89 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  53.19 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  56.6 
 
 		 236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  53.19 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  54.89 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  54.51 
 
 		 244 aa  265  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>