More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0078 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  100 
 
 
236 aa  474  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  72.15 
 
 
238 aa  362  2e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  59.48 
 
 
251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  59.48 
 
 
251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  59.48 
 
 
251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  60.78 
 
 
240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  60.34 
 
 
240 aa  304  8.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  62.5 
 
 
241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  56.36 
 
 
239 aa  302  4.0000000000000003e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  58.55 
 
 
239 aa  301  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  61.11 
 
 
236 aa  301  5.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  57.26 
 
 
239 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  60.26 
 
 
240 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  57.76 
 
 
245 aa  296  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  57.69 
 
 
236 aa  296  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  59.91 
 
 
239 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  60.68 
 
 
240 aa  295  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  60.17 
 
 
249 aa  295  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  56.47 
 
 
274 aa  295  4e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  56.41 
 
 
238 aa  295  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  59.05 
 
 
239 aa  295  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  56.17 
 
 
235 aa  294  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  56.41 
 
 
240 aa  292  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  55.74 
 
 
241 aa  292  4e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  54.7 
 
 
239 aa  291  4e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  54.04 
 
 
237 aa  292  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  54.04 
 
 
237 aa  292  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  54.47 
 
 
237 aa  292  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  56.65 
 
 
239 aa  292  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  56.17 
 
 
237 aa  291  8e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  56.03 
 
 
241 aa  290  9e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  56.03 
 
 
241 aa  290  9e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  55.74 
 
 
237 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  56.65 
 
 
239 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  54.04 
 
 
237 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  56.9 
 
 
238 aa  287  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  57.94 
 
 
235 aa  286  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  56.17 
 
 
235 aa  286  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  56.96 
 
 
241 aa  286  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  55.84 
 
 
244 aa  286  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  53.65 
 
 
235 aa  285  4e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  56.47 
 
 
240 aa  285  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  57.08 
 
 
235 aa  285  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  56.65 
 
 
239 aa  285  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  56.17 
 
 
240 aa  285  5.999999999999999e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  55.13 
 
 
238 aa  284  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  53.85 
 
 
239 aa  284  9e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  55.79 
 
 
244 aa  284  9e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  54.08 
 
 
234 aa  284  9e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  56.41 
 
 
243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  54.27 
 
 
240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  53.65 
 
 
234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  54.98 
 
 
242 aa  283  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  58.8 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  53.85 
 
 
236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  53.81 
 
 
239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  55.36 
 
 
238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  54.94 
 
 
249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  56.41 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  54.7 
 
 
242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  54.11 
 
 
242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  52.97 
 
 
239 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  53.22 
 
 
240 aa  281  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  56.47 
 
 
237 aa  281  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  54.27 
 
 
246 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  54.27 
 
 
243 aa  281  5.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  54.27 
 
 
246 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  53.22 
 
 
240 aa  281  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  54.27 
 
 
246 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  53.65 
 
 
234 aa  281  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  53.22 
 
 
234 aa  281  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  55.41 
 
 
237 aa  281  7.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  57.76 
 
 
237 aa  281  8.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  54.66 
 
 
236 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  55.17 
 
 
244 aa  281  9e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  54.7 
 
 
240 aa  280  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  57.33 
 
 
237 aa  279  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  53.22 
 
 
240 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3993  uridylate kinase  54.42 
 
 
244 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.927712  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  54.04 
 
 
240 aa  278  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  56.03 
 
 
242 aa  278  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  54.31 
 
 
242 aa  277  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  52.56 
 
 
235 aa  277  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  52.81 
 
 
242 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  54.27 
 
 
237 aa  276  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  55.6 
 
 
235 aa  276  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  53.22 
 
 
237 aa  275  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  52.36 
 
 
241 aa  275  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  53.45 
 
 
245 aa  274  8e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  54.98 
 
 
238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  54.47 
 
 
238 aa  274  1.0000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  53.22 
 
 
253 aa  272  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  54.74 
 
 
238 aa  271  5.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  56.65 
 
 
253 aa  271  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  53.71 
 
 
246 aa  271  8.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0266  uridylate kinase  52.54 
 
 
244 aa  270  1e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  54.55 
 
 
237 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4151  uridylate kinase  54.7 
 
 
247 aa  270  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0537318  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  54.47 
 
 
241 aa  270  2e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  54.55 
 
 
237 aa  269  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>