More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1897 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  78.21 
 
 		 235 aa  380  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  78.63 
 
 		 235 aa  381  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  72.53 
 
 		 235 aa  350  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  71.98 
 
 		 237 aa  349  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  67.81 
 
 		 235 aa  339  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  67.52 
 
 		 239 aa  330  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  66.67 
 
 		 236 aa  330  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  67.95 
 
 		 236 aa  329  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  66.67 
 
 		 235 aa  328  4e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  70.61 
 
 		 261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  67.11 
 
 		 244 aa  326  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  64.96 
 
 		 241 aa  326  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  64.22 
 
 		 239 aa  322  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  67.09 
 
 		 239 aa  321  8e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  65.52 
 
 		 239 aa  321  8e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  63.25 
 
 		 239 aa  320  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  64.66 
 
 		 239 aa  319  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  64.22 
 
 		 251 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  64.22 
 
 		 251 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  64.22 
 
 		 251 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  65.53 
 
 		 240 aa  317  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  62.82 
 
 		 239 aa  314  7e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  64.07 
 
 		 249 aa  314  9e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  64.66 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  62.5 
 
 		 238 aa  311  4.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  63.52 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  62.23 
 
 		 239 aa  308  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  63.09 
 
 		 240 aa  308  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  60.34 
 
 		 241 aa  306  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  57.94 
 
 		 240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  58.19 
 
 		 240 aa  304  6e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  60.34 
 
 		 245 aa  304  9.000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  61.04 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  61.04 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  59.31 
 
 		 242 aa  300  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  57.87 
 
 		 237 aa  300  1e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  59.91 
 
 		 274 aa  299  3e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  62.07 
 
 		 236 aa  298  4e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  60.17 
 
 		 242 aa  297  9e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  58.97 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  59.48 
 
 		 242 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  58.01 
 
 		 242 aa  295  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  59.48 
 
 		 238 aa  296  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  58.44 
 
 		 244 aa  295  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  58.37 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  60.61 
 
 		 238 aa  294  7e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  56.41 
 
 		 234 aa  294  8e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  57.76 
 
 		 244 aa  294  9e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  56.22 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  55.32 
 
 		 237 aa  293  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  56.22 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  58.19 
 
 		 237 aa  292  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  58.19 
 
 		 237 aa  292  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  58.19 
 
 		 237 aa  292  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  57.69 
 
 		 245 aa  292  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  58.19 
 
 		 237 aa  292  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  56.84 
 
 		 237 aa  291  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  57.76 
 
 		 237 aa  291  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  57.76 
 
 		 237 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  57.76 
 
 		 237 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  57.76 
 
 		 237 aa  290  9e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  55.98 
 
 		 234 aa  290  9e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  57.76 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  57.76 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  57.76 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  57.76 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  57.76 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  57.76 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  57.76 
 
 		 286 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  55.56 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  55.56 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  58.55 
 
 		 238 aa  288  4e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  56.22 
 
 		 240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  58.97 
 
 		 241 aa  288  6e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  57.33 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  54.47 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  56.17 
 
 		 236 aa  286  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  56.9 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  56.9 
 
 		 237 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  54.89 
 
 		 237 aa  285  2.9999999999999996e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  58.3 
 
 		 243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  57.58 
 
 		 245 aa  285  5e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  57.69 
 
 		 236 aa  285  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  57.08 
 
 		 246 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  55.36 
 
 		 241 aa  285  5.999999999999999e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  58.9 
 
 		 238 aa  284  7e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  57.94 
 
 		 240 aa  284  8e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  53.62 
 
 		 237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  53.62 
 
 		 237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  56.6 
 
 		 243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  58.3 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  55.79 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  58.37 
 
 		 240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  57.33 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  56.84 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  56.03 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  54.74 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  55.93 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  56.6 
 
 		 243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>