More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2388 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  100 
 
 		 244 aa  500  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  68.97 
 
 		 235 aa  344  8.999999999999999e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  70.89 
 
 		 240 aa  343  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  68.97 
 
 		 237 aa  341  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  68.38 
 
 		 235 aa  338  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  67.11 
 
 		 235 aa  326  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  69.33 
 
 		 235 aa  325  3e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  65.09 
 
 		 241 aa  325  5e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  63.09 
 
 		 239 aa  319  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  62.67 
 
 		 239 aa  318  6e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  64.96 
 
 		 235 aa  317  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  64 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  63.56 
 
 		 236 aa  316  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  63.11 
 
 		 235 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  64.22 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  63.36 
 
 		 236 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  63.79 
 
 		 240 aa  311  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  63.56 
 
 		 239 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  63.48 
 
 		 251 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  63.48 
 
 		 251 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  64.35 
 
 		 249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  62.28 
 
 		 239 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  64.04 
 
 		 251 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  64.63 
 
 		 261 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  59.39 
 
 		 274 aa  299  3e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  59.15 
 
 		 245 aa  298  4e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  63.11 
 
 		 239 aa  297  9e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  57.33 
 
 		 238 aa  296  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  59.32 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  61.21 
 
 		 239 aa  295  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  59.21 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  58.8 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  55.46 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  60.27 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  59.13 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  59.13 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  58.44 
 
 		 246 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  58.55 
 
 		 242 aa  289  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  58.55 
 
 		 237 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  57.08 
 
 		 240 aa  288  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  57.89 
 
 		 242 aa  288  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  58.12 
 
 		 237 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  58.55 
 
 		 237 aa  288  7e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  58.12 
 
 		 237 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  58.12 
 
 		 237 aa  288  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  58.12 
 
 		 237 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  61.21 
 
 		 236 aa  287  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  57.45 
 
 		 242 aa  286  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  56.96 
 
 		 246 aa  287  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  57.26 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  58.8 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  57.26 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  58.12 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  56.65 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  57.08 
 
 		 239 aa  286  2.9999999999999996e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  57.26 
 
 		 237 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  57.26 
 
 		 237 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  57.26 
 
 		 237 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  57.26 
 
 		 237 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  57.26 
 
 		 237 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  57.26 
 
 		 237 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  57.26 
 
 		 286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  57.33 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  57.69 
 
 		 237 aa  285  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  57.26 
 
 		 237 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  57.26 
 
 		 237 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  56.9 
 
 		 240 aa  284  8e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  56.78 
 
 		 238 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  58.37 
 
 		 236 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  60.18 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  56.28 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  59.91 
 
 		 236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  56.89 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  56.44 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  58.19 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  56.44 
 
 		 241 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  58.19 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  58.05 
 
 		 238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  54.66 
 
 		 243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2595  uridylate kinase  56.25 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  59.05 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  58.19 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  57.51 
 
 		 258 aa  281  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  55.7 
 
 		 243 aa  281  5.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  58.05 
 
 		 238 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  57.63 
 
 		 238 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  56.44 
 
 		 242 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  56.78 
 
 		 239 aa  281  9e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  55.17 
 
 		 236 aa  281  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  56.65 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  56.65 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  58.37 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  56.49 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  56.03 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  57.45 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  56.64 
 
 		 240 aa  279  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  57.51 
 
 		 240 aa  279  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  57.56 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  55.27 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  56.65 
 
 		 236 aa  278  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>