More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0115 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  100 
 
 		 235 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  71.79 
 
 		 235 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  74.68 
 
 		 237 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  72.53 
 
 		 235 aa  350  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  71.24 
 
 		 235 aa  347  7e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  68.97 
 
 		 244 aa  344  8e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  69.53 
 
 		 235 aa  341  5.999999999999999e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  68.09 
 
 		 240 aa  339  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  66.81 
 
 		 239 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  66.38 
 
 		 239 aa  331  7.000000000000001e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  66.52 
 
 		 241 aa  329  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  64.81 
 
 		 239 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  66.67 
 
 		 239 aa  328  6e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  65.11 
 
 		 236 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  65.11 
 
 		 235 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  67.98 
 
 		 261 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  65.95 
 
 		 240 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  65.52 
 
 		 240 aa  325  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  65.52 
 
 		 239 aa  324  9e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  64.22 
 
 		 241 aa  323  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  64.22 
 
 		 241 aa  323  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  65.09 
 
 		 239 aa  322  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  64.1 
 
 		 236 aa  321  6e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  63.79 
 
 		 251 aa  319  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  63.79 
 
 		 251 aa  319  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  63.79 
 
 		 251 aa  319  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  61.54 
 
 		 239 aa  319  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  63.52 
 
 		 239 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  63.14 
 
 		 238 aa  312  1.9999999999999998e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  63.64 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  59.91 
 
 		 242 aa  304  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  60.78 
 
 		 241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  58.37 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  60.17 
 
 		 242 aa  302  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  59.66 
 
 		 234 aa  301  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  59.75 
 
 		 239 aa  301  7.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  58.37 
 
 		 240 aa  301  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  58.62 
 
 		 244 aa  300  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  62.07 
 
 		 236 aa  300  2e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  59.48 
 
 		 238 aa  299  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  60.17 
 
 		 245 aa  298  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  59.23 
 
 		 234 aa  298  6e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  57.51 
 
 		 240 aa  298  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  58.8 
 
 		 237 aa  297  8e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  58.8 
 
 		 234 aa  297  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  58.19 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  57.08 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  58.26 
 
 		 241 aa  295  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  58.37 
 
 		 234 aa  295  4e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  58.19 
 
 		 274 aa  295  4e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  59.66 
 
 		 236 aa  295  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  58.72 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  58.87 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  59.91 
 
 		 238 aa  295  6e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  57.08 
 
 		 237 aa  294  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  56.17 
 
 		 236 aa  294  6e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  58.44 
 
 		 242 aa  294  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  57.51 
 
 		 237 aa  293  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  55.56 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  58.8 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  58.12 
 
 		 237 aa  292  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  56.84 
 
 		 240 aa  292  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  58.59 
 
 		 246 aa  292  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  57.51 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  57.51 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  58.97 
 
 		 238 aa  290  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  56.65 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  57.58 
 
 		 237 aa  289  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  57.58 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  57.58 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  57.58 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  58.62 
 
 		 238 aa  288  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  57.58 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  57.58 
 
 		 286 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  57.58 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  57.58 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  56.28 
 
 		 242 aa  288  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  57.58 
 
 		 237 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  57.58 
 
 		 237 aa  288  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  57.58 
 
 		 237 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  57.33 
 
 		 242 aa  288  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  57.58 
 
 		 237 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  57.69 
 
 		 240 aa  288  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  57.14 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  58.19 
 
 		 242 aa  286  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  58.19 
 
 		 235 aa  286  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  57.87 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  57.14 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  55.31 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  56.71 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  56.9 
 
 		 237 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  56.9 
 
 		 237 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  56.84 
 
 		 242 aa  285  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  56.41 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  57.26 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  57.14 
 
 		 238 aa  284  8e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  55.6 
 
 		 246 aa  284  8e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4959  uridylate kinase  57.08 
 
 		 248 aa  284  9e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  56.41 
 
 		 243 aa  284  9e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  57.08 
 
 		 239 aa  284  9e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>