More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2046 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  100 
 
 
239 aa  482  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  84.1 
 
 
239 aa  408  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  84.52 
 
 
239 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  84.94 
 
 
239 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  82.35 
 
 
239 aa  401  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  78.9 
 
 
240 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  79.32 
 
 
240 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  73.73 
 
 
241 aa  358  5e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  71.49 
 
 
251 aa  354  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  71.49 
 
 
251 aa  354  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  72.15 
 
 
251 aa  354  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  70.09 
 
 
249 aa  344  6e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  66.11 
 
 
239 aa  333  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  66.11 
 
 
242 aa  329  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  63.4 
 
 
240 aa  327  8e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  64.58 
 
 
240 aa  326  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  67.37 
 
 
239 aa  324  7e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  66.1 
 
 
240 aa  323  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  64.44 
 
 
242 aa  322  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  63.33 
 
 
240 aa  322  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  63.52 
 
 
235 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  64.71 
 
 
239 aa  318  3e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  65.42 
 
 
253 aa  318  6e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  64.26 
 
 
237 aa  318  6e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  66.67 
 
 
237 aa  317  7e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  64.22 
 
 
238 aa  316  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  60.76 
 
 
240 aa  316  2e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  64.83 
 
 
239 aa  316  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  62.71 
 
 
244 aa  315  3e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  63.71 
 
 
244 aa  315  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  64.29 
 
 
238 aa  314  6e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  63.68 
 
 
242 aa  314  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  67.8 
 
 
238 aa  314  8e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  63.6 
 
 
241 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  63.6 
 
 
241 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  62.61 
 
 
238 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  62.66 
 
 
240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  61.51 
 
 
274 aa  312  3.9999999999999997e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  63.14 
 
 
279 aa  311  4.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  62.08 
 
 
245 aa  311  7.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1163  uridylate kinase  63.52 
 
 
265 aa  311  7.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  61.37 
 
 
240 aa  309  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  64.35 
 
 
237 aa  310  2e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  61.37 
 
 
240 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  62.39 
 
 
242 aa  309  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  62.23 
 
 
235 aa  308  4e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  63.45 
 
 
238 aa  308  5e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  60.43 
 
 
239 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  61.8 
 
 
235 aa  308  6.999999999999999e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  59.66 
 
 
235 aa  307  8e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  61.37 
 
 
241 aa  306  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  61.09 
 
 
255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  63.32 
 
 
237 aa  305  3e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  62.03 
 
 
239 aa  306  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  63.71 
 
 
237 aa  305  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  61.44 
 
 
245 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  63.64 
 
 
252 aa  304  7e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  63.29 
 
 
237 aa  304  9.000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  57.92 
 
 
240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  60.43 
 
 
239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1320  uridylate kinase  62.92 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017232  hitchhiker  2.23199e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3866  uridylate kinase  62.92 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0152776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3676  uridylate kinase  62.92 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3566  uridylate kinase  62.92 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.077346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3584  uridylate kinase  62.92 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3872  uridylate kinase  62.92 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000594608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3923  uridylate kinase  62.92 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0560874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3963  uridylate kinase  62.92 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0920824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3837  uridylate kinase  62.92 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.33884e-62 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  59.74 
 
 
234 aa  301  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  60.52 
 
 
236 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  60.59 
 
 
251 aa  301  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  59.58 
 
 
241 aa  301  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  60.94 
 
 
235 aa  301  9e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  65.25 
 
 
240 aa  300  9e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  59.4 
 
 
236 aa  300  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3648  uridylate kinase  62.92 
 
 
240 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  59.74 
 
 
234 aa  299  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  64.26 
 
 
238 aa  299  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  59.83 
 
 
239 aa  300  2e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2477  uridylate kinase  62.08 
 
 
240 aa  300  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000191921  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  59.58 
 
 
241 aa  299  2e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  59.32 
 
 
241 aa  299  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  60.17 
 
 
237 aa  298  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  58.75 
 
 
241 aa  298  4e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  60.34 
 
 
237 aa  298  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  58.37 
 
 
235 aa  298  4e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  58.9 
 
 
245 aa  298  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  59.17 
 
 
241 aa  298  6e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  61.84 
 
 
261 aa  298  6e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  59.31 
 
 
234 aa  298  6e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  61.37 
 
 
253 aa  298  7e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  58.47 
 
 
242 aa  297  8e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  62.45 
 
 
237 aa  297  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  60.09 
 
 
242 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  59.32 
 
 
244 aa  296  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0259  uridylate kinase  63.71 
 
 
239 aa  296  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  58.87 
 
 
234 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  60.26 
 
 
237 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  60.76 
 
 
242 aa  295  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>