More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_319 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  100 
 
 		 241 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  98.34 
 
 		 241 aa  481  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  97.1 
 
 		 241 aa  481  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  62.45 
 
 		 239 aa  314  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  62.08 
 
 		 239 aa  311  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  58.75 
 
 		 240 aa  310  2e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  62.03 
 
 		 240 aa  309  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  61.6 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  61.64 
 
 		 238 aa  307  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  61.8 
 
 		 244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  61.86 
 
 		 251 aa  305  6e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  61.86 
 
 		 251 aa  305  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  60.83 
 
 		 239 aa  302  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  62.23 
 
 		 251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  59.58 
 
 		 239 aa  301  7.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  60.42 
 
 		 239 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  61.02 
 
 		 242 aa  300  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  58.23 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  62.93 
 
 		 249 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  58.65 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  59.41 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  57.81 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  57.5 
 
 		 243 aa  295  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  59.92 
 
 		 255 aa  295  4e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  56.67 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  58.33 
 
 		 242 aa  295  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  61.02 
 
 		 234 aa  294  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  57.81 
 
 		 238 aa  294  1e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  56.25 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  58.97 
 
 		 236 aa  292  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  57.5 
 
 		 248 aa  291  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  58.82 
 
 		 239 aa  291  6e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  57.63 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  57.5 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  57.5 
 
 		 237 aa  290  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  57.63 
 
 		 240 aa  289  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  59.57 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  59.83 
 
 		 234 aa  289  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  55.65 
 
 		 240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  55.65 
 
 		 240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  57.76 
 
 		 244 aa  287  9e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  58.8 
 
 		 242 aa  287  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  58.37 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  57.94 
 
 		 237 aa  285  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  58.55 
 
 		 240 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  56.78 
 
 		 237 aa  286  2.9999999999999996e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  54.36 
 
 		 245 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  55.98 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0527  uridylate kinase  57.08 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  54.81 
 
 		 242 aa  285  5e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  57.81 
 
 		 235 aa  285  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  58.33 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  60.34 
 
 		 238 aa  283  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  58.33 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  58.12 
 
 		 240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  55.04 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  57.69 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  56.41 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4959  uridylate kinase  57.69 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  57.08 
 
 		 274 aa  282  3.0000000000000004e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  59.49 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  55.93 
 
 		 235 aa  281  5.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  55.56 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3515  uridylate kinase  58.97 
 
 		 235 aa  281  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  55.08 
 
 		 236 aa  281  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  54.47 
 
 		 239 aa  281  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  57.2 
 
 		 235 aa  281  9e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  57.08 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  58.72 
 
 		 235 aa  280  1e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  56.36 
 
 		 237 aa  279  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  57.08 
 
 		 239 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  57.94 
 
 		 246 aa  279  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  56.36 
 
 		 237 aa  279  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  59.07 
 
 		 238 aa  279  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  56.54 
 
 		 242 aa  278  4e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  53.33 
 
 		 239 aa  278  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  57.14 
 
 		 244 aa  278  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  54.94 
 
 		 234 aa  278  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  54.66 
 
 		 246 aa  277  8e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  55.98 
 
 		 237 aa  277  9e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  54.24 
 
 		 235 aa  277  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  54.94 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  54.85 
 
 		 239 aa  275  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  57.26 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  56.03 
 
 		 236 aa  276  3e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  58.55 
 
 		 235 aa  276  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0977  uridylate kinase  56.07 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111069  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  58.12 
 
 		 253 aa  275  5e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  54.94 
 
 		 234 aa  275  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  54.08 
 
 		 234 aa  274  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  57.81 
 
 		 239 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  54.85 
 
 		 239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  56.9 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  55.7 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  54.27 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  57.38 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  54.2 
 
 		 237 aa  271  7e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  55.7 
 
 		 245 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2477  uridylate kinase  56.54 
 
 		 240 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000191921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  57.64 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>