More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04055 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  100 
 
 
235 aa  475  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  78.3 
 
 
235 aa  381  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  78.63 
 
 
235 aa  381  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  68.94 
 
 
235 aa  345  5e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  69.53 
 
 
235 aa  341  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  68.97 
 
 
237 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  69.33 
 
 
244 aa  325  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  63.95 
 
 
239 aa  318  3.9999999999999996e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  64.38 
 
 
239 aa  318  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  67.1 
 
 
241 aa  317  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  64.66 
 
 
251 aa  316  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  63.79 
 
 
240 aa  316  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  64.66 
 
 
251 aa  316  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  64.66 
 
 
251 aa  316  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  63.79 
 
 
240 aa  316  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  66.23 
 
 
261 aa  315  5e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  63.68 
 
 
239 aa  314  9e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  65.09 
 
 
249 aa  312  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  65.81 
 
 
240 aa  312  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  64.66 
 
 
239 aa  311  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  63.25 
 
 
241 aa  311  5.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  63.25 
 
 
235 aa  309  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  61.8 
 
 
239 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  63.36 
 
 
239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  63.68 
 
 
239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  62.39 
 
 
236 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  62.39 
 
 
236 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  62.39 
 
 
239 aa  296  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  59.05 
 
 
274 aa  295  4e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  59.91 
 
 
242 aa  295  5e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  57.51 
 
 
237 aa  294  8e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  59.05 
 
 
242 aa  294  9e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  57.83 
 
 
241 aa  292  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  56.22 
 
 
240 aa  291  4e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  56.41 
 
 
237 aa  291  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  56.41 
 
 
240 aa  291  6e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  58.44 
 
 
246 aa  291  7e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  59.91 
 
 
242 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  54.7 
 
 
237 aa  289  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  54.7 
 
 
237 aa  289  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  58.37 
 
 
242 aa  290  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  58.01 
 
 
242 aa  289  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  57.08 
 
 
240 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  56.9 
 
 
246 aa  288  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  58.62 
 
 
241 aa  289  3e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  56.71 
 
 
244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  58.87 
 
 
241 aa  288  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  62.39 
 
 
238 aa  288  6e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  58.87 
 
 
241 aa  288  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  59.05 
 
 
245 aa  288  7e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  56.65 
 
 
240 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  57.58 
 
 
244 aa  286  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  58.55 
 
 
242 aa  287  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  58.44 
 
 
245 aa  287  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1902  uridylate kinase  64.22 
 
 
239 aa  286  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  56.03 
 
 
238 aa  286  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  57.08 
 
 
236 aa  285  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  58.87 
 
 
245 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  56.22 
 
 
240 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  54.7 
 
 
234 aa  284  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  57.69 
 
 
240 aa  284  9e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  58.04 
 
 
241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  54.27 
 
 
234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  58.19 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  54.27 
 
 
234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  56.65 
 
 
243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4959  uridylate kinase  58.55 
 
 
248 aa  281  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  56.65 
 
 
253 aa  281  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  53.85 
 
 
234 aa  281  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  57.69 
 
 
243 aa  281  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  55.86 
 
 
250 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  58.3 
 
 
241 aa  281  8.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  55.17 
 
 
240 aa  281  9e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  58.87 
 
 
238 aa  281  9e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  56.03 
 
 
245 aa  280  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  58.72 
 
 
241 aa  280  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  54.55 
 
 
237 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0259  uridylate kinase  61.54 
 
 
239 aa  280  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  57.69 
 
 
248 aa  280  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  56.84 
 
 
238 aa  279  3e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  55.17 
 
 
242 aa  279  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  56.22 
 
 
243 aa  279  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  56.9 
 
 
238 aa  278  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  57.33 
 
 
235 aa  278  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  56.65 
 
 
246 aa  278  5e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  59.31 
 
 
237 aa  278  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  58.3 
 
 
241 aa  277  9e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  54.51 
 
 
237 aa  277  9e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  57.51 
 
 
237 aa  277  9e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  57.94 
 
 
244 aa  276  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  57.58 
 
 
236 aa  277  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  55.36 
 
 
237 aa  276  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  57.08 
 
 
237 aa  276  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  58.19 
 
 
247 aa  275  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  54.94 
 
 
237 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  54.94 
 
 
237 aa  275  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  54.94 
 
 
237 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  59.48 
 
 
238 aa  275  4e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  54.94 
 
 
237 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  56.22 
 
 
240 aa  275  6e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>