More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1197 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  100 
 
 
241 aa  489  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  72.27 
 
 
245 aa  367  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  70.94 
 
 
242 aa  361  5.0000000000000005e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  71.67 
 
 
240 aa  359  2e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  67.22 
 
 
241 aa  350  8e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0977  uridylate kinase  70.37 
 
 
243 aa  345  3e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111069  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  68.35 
 
 
238 aa  343  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  66.25 
 
 
240 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  64.17 
 
 
240 aa  327  9e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  64.68 
 
 
241 aa  318  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  65.42 
 
 
242 aa  318  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  62.82 
 
 
240 aa  317  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  64.56 
 
 
237 aa  317  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  61.51 
 
 
239 aa  317  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  62.82 
 
 
240 aa  316  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  62.82 
 
 
240 aa  316  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  62.98 
 
 
239 aa  314  7e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  62.66 
 
 
240 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  62.87 
 
 
238 aa  313  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  61.28 
 
 
239 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  62.13 
 
 
239 aa  308  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  62.87 
 
 
235 aa  308  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  60.92 
 
 
255 aa  308  6.999999999999999e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  62.5 
 
 
242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  61.18 
 
 
244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  62.18 
 
 
237 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2477  uridylate kinase  62.5 
 
 
240 aa  304  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000191921  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  60.92 
 
 
240 aa  305  6e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  61.76 
 
 
237 aa  304  9.000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  63.09 
 
 
239 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3866  uridylate kinase  61.67 
 
 
240 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0152776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3676  uridylate kinase  61.67 
 
 
240 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3566  uridylate kinase  61.67 
 
 
240 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.077346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3584  uridylate kinase  61.67 
 
 
240 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3963  uridylate kinase  61.67 
 
 
240 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0920824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3872  uridylate kinase  61.67 
 
 
240 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000594608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3837  uridylate kinase  61.67 
 
 
240 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.33884e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3923  uridylate kinase  61.67 
 
 
240 aa  301  9e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0560874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1320  uridylate kinase  61.67 
 
 
240 aa  300  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017232  hitchhiker  2.23199e-16 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  60.52 
 
 
251 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  60.52 
 
 
251 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  60.52 
 
 
251 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  59.58 
 
 
239 aa  299  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  61.64 
 
 
249 aa  299  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3648  uridylate kinase  61.67 
 
 
240 aa  297  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  58.33 
 
 
239 aa  297  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  61.41 
 
 
253 aa  296  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  56.67 
 
 
241 aa  295  4e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4959  uridylate kinase  58.55 
 
 
248 aa  295  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  61.11 
 
 
242 aa  295  5e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  59.49 
 
 
240 aa  295  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  59.07 
 
 
240 aa  294  8e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  56.67 
 
 
241 aa  294  1e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  57.2 
 
 
240 aa  292  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  60.34 
 
 
239 aa  292  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  60.34 
 
 
236 aa  291  9e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  55.42 
 
 
241 aa  291  9e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0646  uridylate kinase  61.8 
 
 
238 aa  289  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0444  uridylate kinase  58.65 
 
 
235 aa  289  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.014483  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  60.26 
 
 
242 aa  288  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  62.45 
 
 
240 aa  288  6e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  58.97 
 
 
245 aa  288  6e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  61.21 
 
 
237 aa  288  7e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  59.83 
 
 
237 aa  286  2e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  59.4 
 
 
234 aa  286  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  60.52 
 
 
238 aa  286  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  54.58 
 
 
243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  58.9 
 
 
237 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  53.75 
 
 
248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1414  uridylate kinase  57.2 
 
 
249 aa  285  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  58.55 
 
 
244 aa  285  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  59.66 
 
 
237 aa  284  8e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  59.66 
 
 
237 aa  284  8e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  56.49 
 
 
238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  59.4 
 
 
242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  56.41 
 
 
235 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0527  uridylate kinase  52.7 
 
 
246 aa  281  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105771  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  57.74 
 
 
238 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  60.34 
 
 
251 aa  281  7.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  59.49 
 
 
238 aa  281  8.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  58.3 
 
 
237 aa  281  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  54.85 
 
 
239 aa  280  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  56.54 
 
 
239 aa  280  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  58.12 
 
 
235 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1163  uridylate kinase  59.23 
 
 
265 aa  279  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  59.75 
 
 
253 aa  279  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  56.49 
 
 
239 aa  278  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  57.87 
 
 
239 aa  278  4e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  56.9 
 
 
238 aa  278  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  59.23 
 
 
279 aa  278  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  55.08 
 
 
236 aa  278  6e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  59.07 
 
 
242 aa  278  7e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  55.13 
 
 
235 aa  277  9e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  57.26 
 
 
240 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  57.26 
 
 
240 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  54.7 
 
 
236 aa  277  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  57.94 
 
 
234 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  56.41 
 
 
236 aa  276  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  57.08 
 
 
274 aa  276  2e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  55.51 
 
 
234 aa  276  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>