More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1252 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  100 
 
 		 239 aa  482  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  95.82 
 
 		 239 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  87.18 
 
 		 239 aa  418  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  86.55 
 
 		 239 aa  417  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  85.65 
 
 		 240 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  85.65 
 
 		 240 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  84.52 
 
 		 239 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  76.69 
 
 		 241 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  73.16 
 
 		 251 aa  359  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  73.16 
 
 		 251 aa  359  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  73.16 
 
 		 251 aa  358  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  71.67 
 
 		 249 aa  354  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  66.67 
 
 		 240 aa  340  2e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  66.53 
 
 		 242 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  67.23 
 
 		 242 aa  338  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  65.27 
 
 		 242 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  66.25 
 
 		 240 aa  332  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  66.25 
 
 		 240 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  66.39 
 
 		 242 aa  332  4e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  66.52 
 
 		 239 aa  329  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  66.09 
 
 		 244 aa  328  4e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  67.09 
 
 		 239 aa  328  5.0000000000000004e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  66.23 
 
 		 238 aa  327  9e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  68.64 
 
 		 237 aa  327  9e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  68.35 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  68.22 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  65.25 
 
 		 240 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  66.09 
 
 		 239 aa  324  7e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  65.52 
 
 		 235 aa  324  9e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  66.25 
 
 		 253 aa  323  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  67.69 
 
 		 237 aa  323  2e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  64.44 
 
 		 241 aa  323  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  64.44 
 
 		 241 aa  323  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  65.11 
 
 		 237 aa  322  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  67.81 
 
 		 238 aa  322  4e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  65.97 
 
 		 238 aa  321  7e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  64.38 
 
 		 240 aa  321  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  63.64 
 
 		 234 aa  321  7e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  66.38 
 
 		 237 aa  321  7e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  65.52 
 
 		 235 aa  321  8e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  63.52 
 
 		 240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  63.52 
 
 		 240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  62.5 
 
 		 235 aa  319  1.9999999999999998e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  64.07 
 
 		 240 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  65.95 
 
 		 239 aa  319  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  63.4 
 
 		 245 aa  319  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  65.24 
 
 		 245 aa  319  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  63.64 
 
 		 234 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  64.73 
 
 		 244 aa  317  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  63.36 
 
 		 236 aa  317  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  64.38 
 
 		 253 aa  316  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  61.97 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  61.76 
 
 		 255 aa  315  4e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  63.2 
 
 		 234 aa  315  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  64.63 
 
 		 237 aa  315  5e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  67.37 
 
 		 238 aa  315  5e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  63.2 
 
 		 237 aa  315  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  67.37 
 
 		 240 aa  314  8e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  62.77 
 
 		 234 aa  314  9e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1320  uridylate kinase  65.42 
 
 		 240 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017232  hitchhiker  2.23199e-16 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  63.29 
 
 		 237 aa  313  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  63.4 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  62.18 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  62.5 
 
 		 241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3837  uridylate kinase  65 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.33884e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3866  uridylate kinase  65 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0152776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3676  uridylate kinase  65 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3566  uridylate kinase  65 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.077346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3584  uridylate kinase  65 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3963  uridylate kinase  65 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0920824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3872  uridylate kinase  65 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000594608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3923  uridylate kinase  65 
 
 		 240 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0560874  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  64.66 
 
 		 235 aa  311  3.9999999999999997e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  64.5 
 
 		 279 aa  311  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  61.7 
 
 		 239 aa  312  3.9999999999999997e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  61.54 
 
 		 236 aa  311  6.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  61.7 
 
 		 240 aa  310  9e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  62.45 
 
 		 245 aa  310  9e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  63.56 
 
 		 238 aa  310  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3648  uridylate kinase  65 
 
 		 240 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  64.22 
 
 		 237 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2477  uridylate kinase  64.17 
 
 		 240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000191921  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  62.13 
 
 		 241 aa  308  2.9999999999999997e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  65.55 
 
 		 238 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  63.79 
 
 		 237 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  63.79 
 
 		 237 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  63.79 
 
 		 237 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  63.79 
 
 		 237 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  63.6 
 
 		 261 aa  307  8e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  64.71 
 
 		 238 aa  307  8e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  60.17 
 
 		 238 aa  307  9e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  63.09 
 
 		 239 aa  307  9e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  62.71 
 
 		 239 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  62.07 
 
 		 236 aa  306  1.0000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0259  uridylate kinase  65.4 
 
 		 239 aa  307  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  62.29 
 
 		 241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  62.87 
 
 		 242 aa  306  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  61.21 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  63.64 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  61.21 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>