More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1861 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  100 
 
 
242 aa  488  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  76.27 
 
 
246 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  72.15 
 
 
242 aa  355  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  66.95 
 
 
243 aa  340  8e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  67.66 
 
 
245 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  66.38 
 
 
246 aa  330  9e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  65.82 
 
 
240 aa  327  9e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  66.39 
 
 
241 aa  322  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  66.39 
 
 
241 aa  322  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  64.14 
 
 
243 aa  321  5e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  65.27 
 
 
239 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  63.71 
 
 
243 aa  318  3e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  64.56 
 
 
242 aa  317  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  62.03 
 
 
245 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  62.03 
 
 
245 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  61.67 
 
 
240 aa  308  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  61.25 
 
 
240 aa  307  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  62.03 
 
 
247 aa  307  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  62.03 
 
 
239 aa  307  9e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  62.87 
 
 
239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  62.55 
 
 
247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  61.6 
 
 
247 aa  305  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  61.6 
 
 
247 aa  305  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  62.55 
 
 
249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  62.03 
 
 
238 aa  304  7e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  62.87 
 
 
239 aa  304  8.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  62.93 
 
 
237 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  62.5 
 
 
237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  62.5 
 
 
237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  62.5 
 
 
237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  62.5 
 
 
237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  62.03 
 
 
247 aa  302  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  63.68 
 
 
238 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  61.18 
 
 
251 aa  300  9e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  61.18 
 
 
251 aa  300  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  62.07 
 
 
237 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  62.07 
 
 
237 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  62.07 
 
 
237 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  62.07 
 
 
237 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  62.07 
 
 
237 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  62.5 
 
 
237 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  62.07 
 
 
237 aa  300  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  61.51 
 
 
251 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  62.07 
 
 
237 aa  300  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  62.07 
 
 
286 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  61.11 
 
 
236 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  62.07 
 
 
237 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  61.11 
 
 
236 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  61.18 
 
 
247 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  61.11 
 
 
236 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  60.34 
 
 
258 aa  299  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  62.07 
 
 
237 aa  299  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  61.11 
 
 
236 aa  298  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  61.02 
 
 
242 aa  298  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  61.8 
 
 
236 aa  298  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  61.64 
 
 
237 aa  298  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  61.64 
 
 
237 aa  298  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  61.18 
 
 
239 aa  298  7e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  59.75 
 
 
240 aa  298  7e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  60.85 
 
 
247 aa  297  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  58.58 
 
 
245 aa  297  9e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  59.41 
 
 
247 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  61.97 
 
 
236 aa  297  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  61.09 
 
 
249 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  60.43 
 
 
246 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  59.49 
 
 
239 aa  296  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  60.17 
 
 
240 aa  295  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  61.7 
 
 
240 aa  295  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  60.76 
 
 
239 aa  295  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  61.11 
 
 
236 aa  295  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  61.8 
 
 
236 aa  295  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  59.75 
 
 
240 aa  295  5e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  60.59 
 
 
238 aa  295  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  59.75 
 
 
240 aa  295  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  60.68 
 
 
236 aa  295  5e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  57.08 
 
 
274 aa  294  7e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  60.34 
 
 
237 aa  294  9e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  59.15 
 
 
240 aa  293  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  59.32 
 
 
240 aa  294  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  60.17 
 
 
240 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0565  uridylate kinase  59.49 
 
 
253 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  58.37 
 
 
235 aa  291  4e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  60.68 
 
 
236 aa  291  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  56.84 
 
 
237 aa  291  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  60.59 
 
 
241 aa  291  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  59.57 
 
 
247 aa  291  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  58.62 
 
 
242 aa  290  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  58.9 
 
 
243 aa  290  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  59.83 
 
 
237 aa  290  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  58.55 
 
 
245 aa  290  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  58.37 
 
 
235 aa  290  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  58.72 
 
 
241 aa  290  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  59.05 
 
 
246 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  59.05 
 
 
246 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  55.7 
 
 
240 aa  288  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  57.89 
 
 
244 aa  288  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  58.62 
 
 
246 aa  288  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  58.3 
 
 
240 aa  288  6e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  60.25 
 
 
241 aa  288  7e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  57.33 
 
 
235 aa  288  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>