More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2601 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  89.17 
 
 		 240 aa  434  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  87.92 
 
 		 240 aa  428  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  87.92 
 
 		 240 aa  428  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  87.5 
 
 		 240 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  86.67 
 
 		 240 aa  425  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  86.19 
 
 		 240 aa  424  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  88.46 
 
 		 236 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  87.18 
 
 		 236 aa  417  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  85.04 
 
 		 236 aa  411  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  84.62 
 
 		 236 aa  408  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  78.97 
 
 		 237 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  79.49 
 
 		 236 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  78.54 
 
 		 237 aa  384  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  78.21 
 
 		 236 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  78.21 
 
 		 236 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  78.21 
 
 		 258 aa  384  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  78.97 
 
 		 237 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  78.97 
 
 		 237 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  77.78 
 
 		 236 aa  380  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  78.54 
 
 		 237 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  78.11 
 
 		 237 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  78.54 
 
 		 237 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  78.54 
 
 		 237 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  78.54 
 
 		 237 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  78.11 
 
 		 237 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  78.54 
 
 		 237 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  78.54 
 
 		 237 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  78.54 
 
 		 237 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  79.4 
 
 		 237 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  78.11 
 
 		 237 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  78.06 
 
 		 286 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  78.97 
 
 		 237 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  78.11 
 
 		 237 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  78.11 
 
 		 238 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  74.47 
 
 		 238 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  74.36 
 
 		 238 aa  363  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  74.36 
 
 		 236 aa  362  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  74.79 
 
 		 236 aa  360  7.0000000000000005e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2176  uridylate kinase  75.21 
 
 		 237 aa  348  6e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  62.39 
 
 		 241 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  62.39 
 
 		 241 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  59.66 
 
 		 245 aa  299  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  60 
 
 		 242 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  61.7 
 
 		 242 aa  295  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  59.75 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  57.38 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  56.9 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  56.96 
 
 		 251 aa  289  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  56.96 
 
 		 251 aa  289  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  56.9 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  57.87 
 
 		 249 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  59.4 
 
 		 239 aa  287  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  56.9 
 
 		 236 aa  286  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  55.41 
 
 		 242 aa  285  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  59.66 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  57.94 
 
 		 239 aa  284  7e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  58.55 
 
 		 239 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  58.97 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  58.97 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  57.33 
 
 		 239 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  56.65 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  56.9 
 
 		 238 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  55.84 
 
 		 242 aa  281  7.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  57.32 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  57.74 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  57.33 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2595  uridylate kinase  56.12 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  54.74 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  56.84 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  55.51 
 
 		 240 aa  278  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  55.98 
 
 		 243 aa  278  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  57.51 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  57.33 
 
 		 243 aa  278  6e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  54.11 
 
 		 240 aa  278  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  56.54 
 
 		 241 aa  277  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  56.54 
 
 		 241 aa  277  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0787  uridylate kinase  63.91 
 
 		 237 aa  277  9e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  54.94 
 
 		 237 aa  277  9e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  55.17 
 
 		 235 aa  277  9e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  54.51 
 
 		 236 aa  276  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  53.88 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  56.12 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  55.65 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  55.65 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  55.65 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  56.07 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  55.74 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  53.68 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  55.65 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  55.23 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  56.47 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  55.17 
 
 		 237 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  54.11 
 
 		 234 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  55.51 
 
 		 240 aa  275  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  57.14 
 
 		 249 aa  275  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  54.55 
 
 		 274 aa  276  3e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  55.65 
 
 		 242 aa  275  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  54.31 
 
 		 237 aa  275  4e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  55.17 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>