More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1495 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  100 
 
 		 245 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  77.5 
 
 		 242 aa  390  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  69.23 
 
 		 243 aa  348  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  70.09 
 
 		 239 aa  340  9e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  67.66 
 
 		 242 aa  335  3.9999999999999995e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  67.52 
 
 		 246 aa  333  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  64.02 
 
 		 246 aa  325  3e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  66.24 
 
 		 242 aa  320  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  66.24 
 
 		 240 aa  319  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  63.09 
 
 		 243 aa  311  6.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  61.97 
 
 		 238 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  62.66 
 
 		 243 aa  308  6.999999999999999e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  61.41 
 
 		 249 aa  307  9e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  61.86 
 
 		 247 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  61.02 
 
 		 247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  60.59 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  60.59 
 
 		 245 aa  299  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  59.66 
 
 		 240 aa  299  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  59.15 
 
 		 244 aa  298  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  60.17 
 
 		 247 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  60.17 
 
 		 247 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  59.17 
 
 		 240 aa  298  7e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  59.07 
 
 		 245 aa  297  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  60.94 
 
 		 238 aa  296  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  57.14 
 
 		 245 aa  295  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  57.61 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  60.94 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  56.5 
 
 		 247 aa  295  5e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  56.91 
 
 		 247 aa  295  5e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  59 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  60.94 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  58.37 
 
 		 238 aa  294  7e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  60.43 
 
 		 246 aa  294  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  56.41 
 
 		 242 aa  294  9e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  59 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  60.43 
 
 		 247 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  58.02 
 
 		 245 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  58.02 
 
 		 245 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  58.02 
 
 		 245 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  58.02 
 
 		 245 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  59 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  57.61 
 
 		 245 aa  294  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  56.84 
 
 		 242 aa  293  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  58.19 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  58.58 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  58.33 
 
 		 242 aa  292  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  58.37 
 
 		 238 aa  292  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  58.58 
 
 		 247 aa  292  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  57.5 
 
 		 245 aa  292  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  58.44 
 
 		 274 aa  292  4e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  60 
 
 		 247 aa  292  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  57.92 
 
 		 243 aa  292  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  60 
 
 		 247 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  58.33 
 
 		 242 aa  291  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  59 
 
 		 242 aa  291  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  55.88 
 
 		 241 aa  291  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  58.8 
 
 		 240 aa  291  7e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  58.8 
 
 		 240 aa  291  7e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  59.32 
 
 		 241 aa  291  8e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  58.8 
 
 		 240 aa  291  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  56.36 
 
 		 240 aa  291  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  56.36 
 
 		 240 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  57.51 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  55.7 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2639  uridylate kinase  58.16 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000176881  normal  0.106095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2706  uridylate kinase  58.16 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000157467  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  59.31 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  58.37 
 
 		 236 aa  290  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  58.8 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  56.79 
 
 		 249 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0565  uridylate kinase  58.82 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2633  uridylate kinase  56.79 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000396495  normal  0.230715 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  57.74 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3358  uridylate kinase  57.74 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.386876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  55.08 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  59.05 
 
 		 235 aa  288  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  55.98 
 
 		 239 aa  289  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  57.08 
 
 		 245 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  58.37 
 
 		 235 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  56.67 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  57.45 
 
 		 240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  55.41 
 
 		 234 aa  288  6e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  56.65 
 
 		 238 aa  288  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  56.6 
 
 		 253 aa  288  7e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2595  uridylate kinase  57.5 
 
 		 247 aa  288  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  55.08 
 
 		 237 aa  287  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  55.56 
 
 		 237 aa  288  8e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  55.56 
 
 		 237 aa  288  8e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  57.02 
 
 		 240 aa  288  8e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3163  uridylate kinase  56.2 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  56.65 
 
 		 238 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  56.17 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  54.74 
 
 		 234 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2974  uridylate kinase  57.08 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  57.14 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  57.14 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  57.14 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  56.22 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  55.98 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  55.98 
 
 		 239 aa  285  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>