More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1487 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  100 
 
 		 240 aa  482  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  99.58 
 
 		 240 aa  481  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  87.76 
 
 		 239 aa  424  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  86.08 
 
 		 239 aa  411  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  85.65 
 
 		 239 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  81.43 
 
 		 239 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  79.32 
 
 		 239 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  74.04 
 
 		 241 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  73.5 
 
 		 249 aa  354  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  73.28 
 
 		 251 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  73.28 
 
 		 251 aa  352  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  73.28 
 
 		 251 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  66.81 
 
 		 240 aa  332  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  67.37 
 
 		 239 aa  331  7.000000000000001e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  66.39 
 
 		 240 aa  330  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  66.53 
 
 		 242 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  66.67 
 
 		 238 aa  325  3e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  65.52 
 
 		 235 aa  325  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  66.24 
 
 		 237 aa  325  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  65.82 
 
 		 239 aa  325  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  63.14 
 
 		 242 aa  323  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  64.71 
 
 		 244 aa  322  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  64.85 
 
 		 239 aa  322  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  64.66 
 
 		 242 aa  321  6e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  66.81 
 
 		 237 aa  321  7e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  64.94 
 
 		 244 aa  320  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  63.52 
 
 		 240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  64.85 
 
 		 238 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  64.07 
 
 		 234 aa  319  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  66.39 
 
 		 237 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  64.53 
 
 		 241 aa  319  3e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  64.85 
 
 		 239 aa  318  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  67.81 
 
 		 237 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  64.5 
 
 		 234 aa  318  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  65.52 
 
 		 261 aa  318  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  64.66 
 
 		 242 aa  318  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  63.79 
 
 		 235 aa  316  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  62.77 
 
 		 240 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  63.36 
 
 		 235 aa  315  3e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  64.14 
 
 		 241 aa  315  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  64.14 
 
 		 241 aa  315  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  62.34 
 
 		 240 aa  314  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  62.34 
 
 		 240 aa  314  8e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  62.5 
 
 		 236 aa  314  9e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  61.02 
 
 		 240 aa  313  9.999999999999999e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  62.82 
 
 		 245 aa  313  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  64.94 
 
 		 237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  63.71 
 
 		 253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  61.8 
 
 		 235 aa  312  1.9999999999999998e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  65.68 
 
 		 240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  60.5 
 
 		 274 aa  312  2.9999999999999996e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  63.79 
 
 		 244 aa  311  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  62.77 
 
 		 234 aa  311  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  62.71 
 
 		 240 aa  310  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  61.54 
 
 		 239 aa  310  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  62.77 
 
 		 234 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  61.34 
 
 		 237 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  62.03 
 
 		 241 aa  309  2e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1320  uridylate kinase  65.55 
 
 		 240 aa  308  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017232  hitchhiker  2.23199e-16 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  61.37 
 
 		 239 aa  308  5e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  63.09 
 
 		 235 aa  308  5e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  64.07 
 
 		 237 aa  308  5e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  61.67 
 
 		 242 aa  308  5e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0259  uridylate kinase  65.4 
 
 		 239 aa  308  5.9999999999999995e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  61.64 
 
 		 239 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  63.36 
 
 		 236 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  62.03 
 
 		 241 aa  308  6.999999999999999e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  61.86 
 
 		 255 aa  307  9e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  63.18 
 
 		 238 aa  306  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1163  uridylate kinase  62.66 
 
 		 265 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  65.09 
 
 		 238 aa  307  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3923  uridylate kinase  65.13 
 
 		 240 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0560874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  61.67 
 
 		 239 aa  306  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3866  uridylate kinase  65.13 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0152776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3676  uridylate kinase  65.13 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3566  uridylate kinase  65.13 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.077346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3584  uridylate kinase  65.13 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  61.28 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3963  uridylate kinase  65.13 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0920824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  63.18 
 
 		 238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  63.2 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3837  uridylate kinase  65.13 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.33884e-62 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  61.18 
 
 		 241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3872  uridylate kinase  65.13 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000594608  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  65.25 
 
 		 238 aa  305  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  61.02 
 
 		 238 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  64.38 
 
 		 236 aa  305  4.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  60.43 
 
 		 245 aa  305  4.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  60.78 
 
 		 236 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  61.47 
 
 		 237 aa  304  6e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  61.86 
 
 		 246 aa  304  7e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  61.09 
 
 		 241 aa  304  9.000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3648  uridylate kinase  65.55 
 
 		 240 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  62.13 
 
 		 263 aa  303  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  64.38 
 
 		 236 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  62.34 
 
 		 235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  62.34 
 
 		 237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  59.74 
 
 		 237 aa  301  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  59.74 
 
 		 237 aa  301  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2477  uridylate kinase  63.87 
 
 		 240 aa  301  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000191921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>