More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4959 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4959  uridylate kinase  100 
 
 
248 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  74.26 
 
 
248 aa  368  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  74.26 
 
 
243 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0527  uridylate kinase  69.01 
 
 
246 aa  353  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105771  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  61.7 
 
 
240 aa  311  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  59.15 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  58.72 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  60.26 
 
 
242 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  61.02 
 
 
241 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  59.32 
 
 
239 aa  298  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  61.11 
 
 
239 aa  297  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  59.07 
 
 
249 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  58.55 
 
 
241 aa  295  5e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  60.26 
 
 
239 aa  294  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  57.2 
 
 
240 aa  293  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  59.07 
 
 
253 aa  293  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  57.38 
 
 
251 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  57.38 
 
 
251 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  57.38 
 
 
251 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  58.05 
 
 
240 aa  292  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  57.45 
 
 
235 aa  291  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  58.9 
 
 
239 aa  292  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  59.31 
 
 
238 aa  291  8e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  56.36 
 
 
240 aa  290  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  60.76 
 
 
238 aa  290  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  56.36 
 
 
240 aa  290  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  56.85 
 
 
244 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  60.68 
 
 
242 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  58.8 
 
 
240 aa  288  6e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  56.96 
 
 
255 aa  286  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  58.12 
 
 
240 aa  286  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  58.55 
 
 
236 aa  286  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  58.72 
 
 
237 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  57.63 
 
 
238 aa  286  2.9999999999999996e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1320  uridylate kinase  60.85 
 
 
240 aa  284  7e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017232  hitchhiker  2.23199e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  57.74 
 
 
240 aa  285  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  58.3 
 
 
237 aa  284  7e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  56.84 
 
 
240 aa  284  9e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  57.32 
 
 
240 aa  284  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  58.12 
 
 
241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2477  uridylate kinase  60.43 
 
 
240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000191921  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  57.08 
 
 
235 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3923  uridylate kinase  60.43 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0560874  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  58.55 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3866  uridylate kinase  60.43 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0152776  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  53.31 
 
 
242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3676  uridylate kinase  60.43 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3566  uridylate kinase  60.43 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.077346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3584  uridylate kinase  60.43 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3872  uridylate kinase  60.43 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000594608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  57.69 
 
 
241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3963  uridylate kinase  60.43 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0920824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3837  uridylate kinase  60.43 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.33884e-62 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  58.55 
 
 
235 aa  281  5.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  57.63 
 
 
242 aa  281  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  57.69 
 
 
241 aa  281  8.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  54.66 
 
 
245 aa  280  1e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  55.27 
 
 
237 aa  279  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3648  uridylate kinase  60 
 
 
240 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  57.38 
 
 
240 aa  280  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  58.12 
 
 
235 aa  280  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  57.08 
 
 
239 aa  278  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  56.36 
 
 
239 aa  278  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  55.79 
 
 
238 aa  277  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  55.27 
 
 
239 aa  275  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  57.08 
 
 
234 aa  275  5e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  55.79 
 
 
274 aa  275  5e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  56.96 
 
 
244 aa  275  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  55.56 
 
 
235 aa  274  7e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  57.69 
 
 
239 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  55.51 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  55.74 
 
 
241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  55.93 
 
 
245 aa  272  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  55.08 
 
 
242 aa  271  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  57.51 
 
 
250 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  56.03 
 
 
236 aa  270  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  55.27 
 
 
239 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  54.94 
 
 
252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  59.07 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  55.56 
 
 
235 aa  268  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  56.65 
 
 
234 aa  268  7e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  55.6 
 
 
240 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  54.7 
 
 
239 aa  267  8.999999999999999e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3241  uridylate kinase  55.79 
 
 
237 aa  267  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  54.51 
 
 
235 aa  266  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  52.3 
 
 
242 aa  266  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  55.17 
 
 
240 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1417  uridylate kinase  56.41 
 
 
253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  54.94 
 
 
250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  54.04 
 
 
237 aa  265  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  54.74 
 
 
251 aa  265  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  55.51 
 
 
237 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  53.39 
 
 
245 aa  265  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  56.41 
 
 
239 aa  264  8e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  55.08 
 
 
237 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  55.08 
 
 
237 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  52.52 
 
 
242 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  55.08 
 
 
237 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  52.97 
 
 
244 aa  263  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  55.6 
 
 
236 aa  264  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>