More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0474 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  87.45 
 
 		 242 aa  435  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  72.27 
 
 		 241 aa  367  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  67.93 
 
 		 238 aa  335  3.9999999999999995e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  64.58 
 
 		 240 aa  334  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  64.17 
 
 		 240 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  64.98 
 
 		 240 aa  328  4e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0977  uridylate kinase  66.95 
 
 		 243 aa  327  1.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111069  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  61.18 
 
 		 241 aa  318  6e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  61.97 
 
 		 240 aa  317  9e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  61.97 
 
 		 240 aa  317  9e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  60.25 
 
 		 255 aa  313  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  60.68 
 
 		 240 aa  312  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  61.67 
 
 		 237 aa  308  5e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  61.25 
 
 		 237 aa  306  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  60.34 
 
 		 244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  60.5 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  59.02 
 
 		 253 aa  298  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  59.49 
 
 		 242 aa  298  7e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2477  uridylate kinase  60.42 
 
 		 240 aa  298  7e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000191921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  59.92 
 
 		 242 aa  297  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3866  uridylate kinase  60 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0152776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3837  uridylate kinase  60 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.33884e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3676  uridylate kinase  60 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3566  uridylate kinase  60 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.077346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3584  uridylate kinase  60 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3963  uridylate kinase  60 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0920824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3872  uridylate kinase  60 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000594608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3923  uridylate kinase  60 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0560874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  58.23 
 
 		 239 aa  295  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  59.17 
 
 		 239 aa  295  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3648  uridylate kinase  59.58 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  58.23 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  59.17 
 
 		 239 aa  295  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  60.52 
 
 		 239 aa  295  6e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1320  uridylate kinase  59.58 
 
 		 240 aa  295  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017232  hitchhiker  2.23199e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0527  uridylate kinase  55.83 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  58.3 
 
 		 238 aa  292  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  57.08 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  58.23 
 
 		 235 aa  290  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  59.07 
 
 		 237 aa  288  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  56.54 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  57.08 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  55.83 
 
 		 249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  54.36 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  55.42 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  57.38 
 
 		 240 aa  284  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  57.38 
 
 		 240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  54.58 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  53.94 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  55.08 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  55.08 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  55.36 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  54.66 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3989  uridylate kinase  58.05 
 
 		 261 aa  281  7.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  57.14 
 
 		 242 aa  281  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  56.25 
 
 		 244 aa  281  8.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  57.26 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4959  uridylate kinase  54.66 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  53.11 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1163  uridylate kinase  58.12 
 
 		 265 aa  278  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  54.81 
 
 		 240 aa  278  4e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  59.66 
 
 		 279 aa  278  5e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  59.05 
 
 		 251 aa  277  9e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  55 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  58.23 
 
 		 238 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  56.96 
 
 		 238 aa  275  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3241  uridylate kinase  59.23 
 
 		 237 aa  275  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  55.93 
 
 		 237 aa  274  9e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  55.93 
 
 		 237 aa  274  9e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  55.23 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  56.41 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  54.89 
 
 		 245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  55.56 
 
 		 237 aa  272  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  58.23 
 
 		 266 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  56.17 
 
 		 237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  57.81 
 
 		 238 aa  271  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  58.23 
 
 		 240 aa  271  9e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  55.79 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  53.78 
 
 		 242 aa  269  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  55.51 
 
 		 237 aa  268  5e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0646  uridylate kinase  57.26 
 
 		 238 aa  268  5e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  54.51 
 
 		 234 aa  268  5.9999999999999995e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  54.89 
 
 		 234 aa  268  8.999999999999999e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  54.7 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  57.08 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  55.56 
 
 		 236 aa  267  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  52.5 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  52.5 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  54.85 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  55.88 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  55.46 
 
 		 244 aa  265  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  55.93 
 
 		 239 aa  265  5.999999999999999e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  55.7 
 
 		 274 aa  265  5.999999999999999e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  54.62 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0444  uridylate kinase  53.59 
 
 		 235 aa  263  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.014483  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  56.78 
 
 		 252 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  56.78 
 
 		 252 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  53.19 
 
 		 235 aa  264  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  53.31 
 
 		 245 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>