More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3989 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3989  uridylate kinase  100 
 
 		 261 aa  532  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  71.54 
 
 		 266 aa  347  8e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  69.88 
 
 		 250 aa  346  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  71.91 
 
 		 250 aa  342  4e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  70.69 
 
 		 252 aa  334  7e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4124  uridylate kinase  68.49 
 
 		 247 aa  327  8e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  68.8 
 
 		 279 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12897  uridylate kinase  64.2 
 
 		 261 aa  324  9e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3241  uridylate kinase  66.09 
 
 		 237 aa  322  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  66.13 
 
 		 251 aa  322  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  68.97 
 
 		 252 aa  321  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  68.97 
 
 		 252 aa  321  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2049  uridylate kinase  68.97 
 
 		 287 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3111  uridylate kinase  68.94 
 
 		 257 aa  319  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000029028  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1531  uridylate kinase  66.12 
 
 		 254 aa  315  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0482358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  63.56 
 
 		 251 aa  315  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2110  uridylate kinase  68.91 
 
 		 246 aa  315  6e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1486  uridylate kinase  65.24 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.891753  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5909  uridylate kinase  70.25 
 
 		 263 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.166242  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23590  uridylate kinase  65.69 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.192648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1417  uridylate kinase  62.06 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  65.68 
 
 		 252 aa  310  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0807  UMP kinase  62.4 
 
 		 249 aa  305  6e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1386  uridylate kinase  61.57 
 
 		 245 aa  305  6e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1006  uridylate kinase  63.31 
 
 		 252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1369  uridylate kinase  62.77 
 
 		 245 aa  302  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1182  uridylate kinase  67.97 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2505  uridylate kinase  64.94 
 
 		 265 aa  299  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.234958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1163  uridylate kinase  63.83 
 
 		 265 aa  299  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11210  uridylate kinase  66.23 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.139884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06760  uridylate kinase  57.75 
 
 		 289 aa  293  2e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000401703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1232  uridylate kinase  64.61 
 
 		 251 aa  291  9e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0721616  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0996  uridylate kinase  64.63 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.405084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1324  uridylate kinase  64.61 
 
 		 255 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1865  uridylate kinase  66.09 
 
 		 256 aa  288  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0872055 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  60.34 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  59.05 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  61.47 
 
 		 238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  58.05 
 
 		 245 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2200  uridylate kinase  64.22 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  59.49 
 
 		 239 aa  278  9e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  60.59 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  59.05 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  58.37 
 
 		 241 aa  274  8e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  57.87 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  57.87 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  56.78 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  56.78 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  57.69 
 
 		 237 aa  271  7e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  59.4 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  57.33 
 
 		 239 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  56.72 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  57.02 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  60 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  55.08 
 
 		 242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  56.72 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  56.72 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  56.72 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  57.94 
 
 		 234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  56.47 
 
 		 239 aa  268  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0405  uridylate kinase  68.23 
 
 		 224 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0118256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  57.33 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  58.37 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  57.94 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  56.17 
 
 		 242 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  57.94 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0977  uridylate kinase  57.45 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  58.62 
 
 		 242 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  57.26 
 
 		 240 aa  265  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  57.02 
 
 		 242 aa  265  8e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  57.51 
 
 		 234 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  55.36 
 
 		 239 aa  264  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  56.84 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  54.94 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  56.28 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  56.9 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  57.32 
 
 		 253 aa  262  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  55.88 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  58.8 
 
 		 237 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  55.56 
 
 		 249 aa  261  6e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  56.65 
 
 		 234 aa  261  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  56.22 
 
 		 239 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  56.22 
 
 		 239 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  54.51 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  58.37 
 
 		 237 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  56.65 
 
 		 239 aa  260  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  56.03 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  59.48 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  56.03 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  54.47 
 
 		 236 aa  258  7e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2477  uridylate kinase  59.48 
 
 		 240 aa  258  8e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000191921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  56.47 
 
 		 240 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  55.36 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  55.17 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  55.17 
 
 		 242 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  56.41 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  55.36 
 
 		 238 aa  257  2e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3866  uridylate kinase  59.05 
 
 		 240 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0152776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3963  uridylate kinase  59.05 
 
 		 240 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0920824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3837  uridylate kinase  59.05 
 
 		 240 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.33884e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>