More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0807 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0807  UMP kinase  100 
 
 		 249 aa  503  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1486  uridylate kinase  77.64 
 
 		 251 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.891753  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1006  uridylate kinase  74.68 
 
 		 252 aa  355  2.9999999999999997e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23590  uridylate kinase  76.92 
 
 		 249 aa  355  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.192648 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0405  uridylate kinase  90.58 
 
 		 224 aa  355  5e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0118256  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1182  uridylate kinase  75.53 
 
 		 248 aa  344  8.999999999999999e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  71 
 
 		 250 aa  337  9e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2505  uridylate kinase  72.15 
 
 		 265 aa  336  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.234958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1386  uridylate kinase  67.8 
 
 		 245 aa  332  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273157 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1369  uridylate kinase  68.09 
 
 		 245 aa  328  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06760  uridylate kinase  65.15 
 
 		 289 aa  325  6e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000401703  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3241  uridylate kinase  67.97 
 
 		 237 aa  323  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1417  uridylate kinase  69.13 
 
 		 253 aa  312  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3989  uridylate kinase  62.4 
 
 		 261 aa  305  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  65.68 
 
 		 250 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  64.5 
 
 		 252 aa  295  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  64.5 
 
 		 252 aa  295  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2049  uridylate kinase  64.5 
 
 		 287 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1232  uridylate kinase  65.53 
 
 		 251 aa  295  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0721616  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1324  uridylate kinase  65.11 
 
 		 255 aa  294  7e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11210  uridylate kinase  65.37 
 
 		 245 aa  293  3e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.139884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  62.39 
 
 		 266 aa  291  6e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  62.77 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  63.03 
 
 		 279 aa  289  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2200  uridylate kinase  62.7 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1531  uridylate kinase  61.6 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0482358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  61.74 
 
 		 252 aa  285  4e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4124  uridylate kinase  59.75 
 
 		 247 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12897  uridylate kinase  62.5 
 
 		 261 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  61.47 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3111  uridylate kinase  61.04 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000029028  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  60.25 
 
 		 252 aa  275  7e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2110  uridylate kinase  63.76 
 
 		 246 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5909  uridylate kinase  64.41 
 
 		 263 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.166242  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1163  uridylate kinase  58.33 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  57.08 
 
 		 244 aa  258  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1865  uridylate kinase  61.44 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0872055 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0996  uridylate kinase  61.86 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.405084 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0977  uridylate kinase  54.77 
 
 		 243 aa  256  3e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111069  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  55.98 
 
 		 234 aa  254  8e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  56.78 
 
 		 240 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  55.13 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  53.16 
 
 		 242 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  52.74 
 
 		 245 aa  248  7e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  54.24 
 
 		 240 aa  248  9e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  54.81 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  55.23 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  54.98 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  55.84 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  56.65 
 
 		 239 aa  245  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  56.9 
 
 		 241 aa  244  6.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  51.49 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  55.17 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  54.01 
 
 		 241 aa  242  3e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  55.41 
 
 		 239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  53.36 
 
 		 239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  52.32 
 
 		 243 aa  241  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  51.87 
 
 		 240 aa  241  7.999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  54.98 
 
 		 242 aa  241  7.999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  52.14 
 
 		 241 aa  241  7.999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  54.11 
 
 		 242 aa  241  9e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  53.16 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  53.68 
 
 		 238 aa  239  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  53.59 
 
 		 241 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  52.3 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  52.46 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  52.46 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  52.26 
 
 		 249 aa  238  5e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  51.49 
 
 		 235 aa  238  5.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  51.29 
 
 		 234 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  51.49 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  51.93 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  51.49 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  51.29 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  52.81 
 
 		 242 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  50.85 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  51.29 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  51.29 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  51.05 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  51.28 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  54.51 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  51.91 
 
 		 236 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4959  uridylate kinase  50.42 
 
 		 248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  50.21 
 
 		 235 aa  235  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  51.52 
 
 		 244 aa  235  6e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  52.81 
 
 		 240 aa  235  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  52.36 
 
 		 237 aa  234  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  52.81 
 
 		 240 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  54.01 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  53.22 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  49.59 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  54.98 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  54.08 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  50.64 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  50.84 
 
 		 237 aa  232  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  51.93 
 
 		 235 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  52.38 
 
 		 240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  50.84 
 
 		 240 aa  231  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  49.36 
 
 		 241 aa  230  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  52.3 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>