More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12897 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12897  uridylate kinase  100 
 
 
261 aa  520  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4124  uridylate kinase  90.09 
 
 
247 aa  427  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  91.38 
 
 
251 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  86 
 
 
252 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  86 
 
 
252 aa  421  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2049  uridylate kinase  84.38 
 
 
287 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  81.03 
 
 
252 aa  391  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  80.26 
 
 
250 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2110  uridylate kinase  78.23 
 
 
246 aa  364  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3111  uridylate kinase  76.39 
 
 
257 aa  359  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000029028  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  73.17 
 
 
266 aa  357  8e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5909  uridylate kinase  78.24 
 
 
263 aa  344  8e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.166242  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1417  uridylate kinase  63.12 
 
 
253 aa  325  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3989  uridylate kinase  64.2 
 
 
261 aa  324  9e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  69.57 
 
 
250 aa  323  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3241  uridylate kinase  67.66 
 
 
237 aa  323  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1163  uridylate kinase  64.14 
 
 
265 aa  321  6e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  65.2 
 
 
251 aa  319  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  67.38 
 
 
279 aa  315  6e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1232  uridylate kinase  72.29 
 
 
251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0721616  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  64.37 
 
 
252 aa  310  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1369  uridylate kinase  65.65 
 
 
245 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1386  uridylate kinase  64.94 
 
 
245 aa  308  4e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1324  uridylate kinase  71.43 
 
 
255 aa  308  8e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2505  uridylate kinase  69.26 
 
 
265 aa  306  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.234958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1531  uridylate kinase  65.98 
 
 
254 aa  305  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0482358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0996  uridylate kinase  66.26 
 
 
256 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.405084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2200  uridylate kinase  65.97 
 
 
244 aa  298  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1865  uridylate kinase  63.75 
 
 
256 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0872055 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1486  uridylate kinase  64.38 
 
 
251 aa  294  9e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.891753  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06760  uridylate kinase  59.51 
 
 
289 aa  292  4e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000401703  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11210  uridylate kinase  67.39 
 
 
245 aa  291  6e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.139884  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23590  uridylate kinase  65.67 
 
 
249 aa  291  9e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.192648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1006  uridylate kinase  64.5 
 
 
252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0807  UMP kinase  62.5 
 
 
249 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  59.31 
 
 
240 aa  277  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  58.87 
 
 
240 aa  276  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  60.17 
 
 
242 aa  274  9e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  60.78 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  57.08 
 
 
240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  58.19 
 
 
240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  58.01 
 
 
239 aa  271  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  55.84 
 
 
239 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  58.01 
 
 
239 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  58.12 
 
 
241 aa  270  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  56.3 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  56.3 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  57.58 
 
 
239 aa  269  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  57.08 
 
 
242 aa  269  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  57.14 
 
 
239 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  57.76 
 
 
240 aa  268  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  54.92 
 
 
251 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  56.28 
 
 
251 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  54.92 
 
 
251 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1182  uridylate kinase  64.35 
 
 
248 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  55.88 
 
 
240 aa  265  5e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  57.14 
 
 
253 aa  265  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  57.2 
 
 
239 aa  265  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  57.14 
 
 
238 aa  265  8e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  54.98 
 
 
242 aa  264  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  55.32 
 
 
235 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  55.36 
 
 
242 aa  263  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  57.14 
 
 
242 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  56.28 
 
 
240 aa  262  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  56.28 
 
 
240 aa  262  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  56.28 
 
 
244 aa  262  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  54.11 
 
 
236 aa  261  6e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  55.41 
 
 
249 aa  261  6e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  57.58 
 
 
240 aa  261  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  54.94 
 
 
240 aa  259  2e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  54.08 
 
 
234 aa  260  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  57.58 
 
 
241 aa  259  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1047  uridylate kinase  56.67 
 
 
257 aa  259  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.309878  normal  0.307589 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  55.98 
 
 
242 aa  258  9e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  55.13 
 
 
243 aa  258  9e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  53.22 
 
 
237 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  55.84 
 
 
234 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  53.68 
 
 
239 aa  256  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  55.13 
 
 
248 aa  256  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  58.44 
 
 
240 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  53.88 
 
 
241 aa  256  4e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  52.14 
 
 
241 aa  255  5e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  56.71 
 
 
238 aa  255  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  55.41 
 
 
245 aa  255  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  55.6 
 
 
239 aa  254  7e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  55.41 
 
 
237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  55.84 
 
 
240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  54.98 
 
 
239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  54.08 
 
 
235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  52.56 
 
 
239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  53.02 
 
 
234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  51.71 
 
 
241 aa  253  3e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  55.84 
 
 
241 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  55.84 
 
 
241 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  53.65 
 
 
237 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  54.27 
 
 
245 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  55.41 
 
 
237 aa  251  6e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  52.59 
 
 
234 aa  251  7e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  53.02 
 
 
235 aa  251  9.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  55.17 
 
 
237 aa  250  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>