More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4124 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4124  uridylate kinase  100 
 
 
247 aa  494  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  90.65 
 
 
251 aa  447  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  87.7 
 
 
252 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  87.7 
 
 
252 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2049  uridylate kinase  87.7 
 
 
287 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12897  uridylate kinase  90.09 
 
 
261 aa  427  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  83.76 
 
 
252 aa  406  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  78.84 
 
 
250 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3111  uridylate kinase  77.73 
 
 
257 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000029028  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2110  uridylate kinase  79.01 
 
 
246 aa  368  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  74.9 
 
 
266 aa  362  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5909  uridylate kinase  81.12 
 
 
263 aa  346  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.166242  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3989  uridylate kinase  68.49 
 
 
261 aa  327  7e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1417  uridylate kinase  68.97 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  68.49 
 
 
250 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3241  uridylate kinase  68.1 
 
 
237 aa  325  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1163  uridylate kinase  65.57 
 
 
265 aa  322  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  67.66 
 
 
279 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1232  uridylate kinase  68.95 
 
 
251 aa  317  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0721616  hitchhiker  0.0052934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  67.97 
 
 
251 aa  316  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  65.7 
 
 
252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1324  uridylate kinase  71 
 
 
255 aa  311  5.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2200  uridylate kinase  67.93 
 
 
244 aa  309  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2505  uridylate kinase  67.22 
 
 
265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.234958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1369  uridylate kinase  62.92 
 
 
245 aa  307  8e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1386  uridylate kinase  62.24 
 
 
245 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1531  uridylate kinase  64.88 
 
 
254 aa  301  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0482358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0996  uridylate kinase  67.66 
 
 
256 aa  300  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.405084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1486  uridylate kinase  64.44 
 
 
251 aa  299  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.891753  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1865  uridylate kinase  66.81 
 
 
256 aa  294  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0872055 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11210  uridylate kinase  64.44 
 
 
245 aa  292  3e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.139884  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23590  uridylate kinase  62.35 
 
 
249 aa  289  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.192648 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06760  uridylate kinase  58.7 
 
 
289 aa  288  5.0000000000000004e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000401703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1006  uridylate kinase  62.76 
 
 
252 aa  285  5.999999999999999e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0807  UMP kinase  59.75 
 
 
249 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  58.87 
 
 
239 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  57.69 
 
 
239 aa  278  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  58.44 
 
 
240 aa  279  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  58.01 
 
 
240 aa  278  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  56.71 
 
 
239 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  57.58 
 
 
239 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  57.45 
 
 
239 aa  275  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  58.01 
 
 
242 aa  271  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  55.65 
 
 
251 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  54.36 
 
 
251 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  54.36 
 
 
251 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  60.34 
 
 
244 aa  270  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  57.33 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  56.96 
 
 
238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  53.94 
 
 
249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1182  uridylate kinase  62.08 
 
 
248 aa  267  8.999999999999999e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  56.72 
 
 
242 aa  267  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  57.76 
 
 
240 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  57.69 
 
 
241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  56.17 
 
 
239 aa  265  7e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  56.28 
 
 
242 aa  264  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  55.79 
 
 
240 aa  264  8.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  55.84 
 
 
242 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  55.84 
 
 
235 aa  263  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  57.33 
 
 
253 aa  263  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  56.65 
 
 
240 aa  263  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  54.7 
 
 
244 aa  263  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  57.69 
 
 
242 aa  263  3e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  56.28 
 
 
242 aa  261  8.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  57.39 
 
 
238 aa  260  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  55.84 
 
 
234 aa  259  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  56.67 
 
 
241 aa  259  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  55.98 
 
 
243 aa  259  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  56.41 
 
 
245 aa  259  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  54.51 
 
 
240 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  54.51 
 
 
240 aa  259  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  52.99 
 
 
237 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  56.9 
 
 
253 aa  259  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  55.98 
 
 
242 aa  258  6e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  56.9 
 
 
239 aa  258  7e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  56.58 
 
 
261 aa  258  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  55.98 
 
 
248 aa  258  8e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  58.44 
 
 
240 aa  258  8e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  54.08 
 
 
240 aa  257  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  53.65 
 
 
234 aa  257  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  56.71 
 
 
245 aa  257  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  53.62 
 
 
239 aa  257  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  55.84 
 
 
240 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  56.22 
 
 
255 aa  256  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  55.84 
 
 
237 aa  255  4e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  54.81 
 
 
240 aa  255  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  55.6 
 
 
235 aa  254  7e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0527  uridylate kinase  54.04 
 
 
246 aa  254  7e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105771  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  54.98 
 
 
240 aa  254  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  54.98 
 
 
240 aa  254  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  54.11 
 
 
239 aa  254  9e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  52.16 
 
 
234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1047  uridylate kinase  55 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.309878  normal  0.307589 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  53.25 
 
 
236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  52.59 
 
 
234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  55.41 
 
 
237 aa  251  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  54.51 
 
 
235 aa  251  5.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  51.91 
 
 
274 aa  251  8.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  53.42 
 
 
237 aa  251  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  53.42 
 
 
239 aa  251  1e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>