More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1047 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1047  uridylate kinase  100 
 
 		 257 aa  519  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.309878  normal  0.307589 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  67.23 
 
 		 234 aa  328  4e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  63.18 
 
 		 234 aa  311  7.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  56.92 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  58.51 
 
 		 239 aa  284  9e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  59.66 
 
 		 242 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  60.5 
 
 		 242 aa  281  9e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  55.91 
 
 		 255 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  58.82 
 
 		 239 aa  278  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  57.85 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  60.92 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  60.92 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  57.98 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  57.56 
 
 		 242 aa  274  9e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  58.33 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  57.98 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  57.98 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  57.98 
 
 		 251 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  55.83 
 
 		 237 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  56.02 
 
 		 239 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  55.42 
 
 		 237 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  55.27 
 
 		 235 aa  271  8.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  54.36 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  57.32 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1400  uridylate kinase  57.49 
 
 		 255 aa  271  9e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  55.04 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  56.9 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  58.82 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  56.02 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  54.62 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  52.48 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  58.33 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  56.02 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  57.26 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  57.74 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  55.47 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  55.23 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  56.43 
 
 		 241 aa  269  4e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  53.78 
 
 		 240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  53.78 
 
 		 240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  57.56 
 
 		 242 aa  268  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  57.14 
 
 		 244 aa  268  8e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  56.43 
 
 		 241 aa  268  8.999999999999999e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  57.98 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  55.46 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  58.82 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  55.37 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  56.3 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1540  uridylate kinase  57.68 
 
 		 266 aa  267  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  55.42 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  55.46 
 
 		 234 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  55.88 
 
 		 234 aa  265  4e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  57.56 
 
 		 249 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  55.6 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  55.65 
 
 		 238 aa  265  5e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  54.55 
 
 		 241 aa  265  5.999999999999999e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0527  uridylate kinase  54.96 
 
 		 246 aa  264  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  52.94 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  53.94 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0977  uridylate kinase  56.38 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111069  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  55.65 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  56.02 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  54.77 
 
 		 237 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  58.4 
 
 		 252 aa  263  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  54.77 
 
 		 237 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  56.72 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0474  uridylate kinase  53.53 
 
 		 245 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  53.53 
 
 		 248 aa  261  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1984  uridylate kinase  56.43 
 
 		 252 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2003  uridylate kinase  56.43 
 
 		 252 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  57.56 
 
 		 279 aa  260  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4959  uridylate kinase  56.49 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  55.37 
 
 		 245 aa  259  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2049  uridylate kinase  56.43 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  54.81 
 
 		 239 aa  260  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  56.25 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  55.79 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  55.79 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  56.12 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12897  uridylate kinase  56.67 
 
 		 261 aa  259  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1163  uridylate kinase  59.34 
 
 		 265 aa  259  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  55.27 
 
 		 239 aa  258  5.0000000000000005e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  55.46 
 
 		 242 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09910  uridylate kinase  55.42 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  56.72 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  52.7 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  56.72 
 
 		 237 aa  256  3e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  53.75 
 
 		 245 aa  256  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3989  uridylate kinase  56.43 
 
 		 261 aa  255  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  55.23 
 
 		 242 aa  255  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1513  uridylate kinase  51.04 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00553503  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4124  uridylate kinase  55 
 
 		 247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  54.39 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  54.62 
 
 		 238 aa  253  3e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1673  uridylate kinase  55.46 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1417  uridylate kinase  55.04 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3515  uridylate kinase  56.02 
 
 		 235 aa  251  7e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  52.08 
 
 		 236 aa  251  8.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0646  uridylate kinase  52.5 
 
 		 238 aa  251  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289065  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1369  uridylate kinase  54.85 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>