More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1400 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1400  uridylate kinase  100 
 
 		 255 aa  507  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  59.05 
 
 		 240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  59.48 
 
 		 236 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  57.51 
 
 		 239 aa  281  7.000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  57.76 
 
 		 240 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1429  uridylate kinase  58.55 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000438582  normal  0.0570585 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  57.69 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  57.69 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  57.87 
 
 		 239 aa  278  7e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  57.69 
 
 		 251 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  56.9 
 
 		 237 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  59.4 
 
 		 244 aa  275  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  57.98 
 
 		 243 aa  275  7e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  59.05 
 
 		 242 aa  274  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  57.69 
 
 		 239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  57.14 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  57.2 
 
 		 239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  58.55 
 
 		 249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  58.87 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  61.7 
 
 		 255 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  57.02 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  57.02 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  59.24 
 
 		 239 aa  273  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  57.76 
 
 		 234 aa  272  5.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  59.15 
 
 		 240 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  56.36 
 
 		 239 aa  271  7e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1047  uridylate kinase  57.49 
 
 		 257 aa  271  9e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.309878  normal  0.307589 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  58.19 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  56.3 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  52.92 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  52.92 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  56.41 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  58.95 
 
 		 237 aa  268  5e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  56.47 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  58.19 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  56.9 
 
 		 239 aa  268  8e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  58.47 
 
 		 251 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  57.33 
 
 		 234 aa  267  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  56.9 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  56.9 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  56.9 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  56.9 
 
 		 236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  56.47 
 
 		 234 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  56.5 
 
 		 253 aa  265  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  57.76 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  52.67 
 
 		 240 aa  265  5.999999999999999e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  58.52 
 
 		 237 aa  265  5.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  57.33 
 
 		 240 aa  265  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  56.47 
 
 		 234 aa  264  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  55.32 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  57.14 
 
 		 239 aa  263  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  55.74 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0375  uridylate kinase  55.74 
 
 		 241 aa  263  3e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  57.64 
 
 		 237 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  54.31 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  54.89 
 
 		 241 aa  261  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  56.47 
 
 		 234 aa  262  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  56.9 
 
 		 240 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  56.47 
 
 		 242 aa  261  6e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  56.9 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  52.59 
 
 		 241 aa  261  6e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  56.03 
 
 		 244 aa  261  6.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  55.98 
 
 		 241 aa  261  8e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  56.22 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  57.26 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  57.26 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  55.6 
 
 		 236 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  57.32 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13319  predicted protein  56.77 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.494059  normal  0.0799913 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  59.83 
 
 		 238 aa  259  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  56.03 
 
 		 238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  55.04 
 
 		 238 aa  258  7e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  54.98 
 
 		 237 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  56.02 
 
 		 242 aa  258  8e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0678  uridylate kinase  56.43 
 
 		 252 aa  258  9e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0224373  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  57.2 
 
 		 261 aa  258  9e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2292  uridylate kinase  53.88 
 
 		 238 aa  258  9e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  57.02 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4959  uridylate kinase  54.62 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  58.19 
 
 		 243 aa  256  3e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  55.74 
 
 		 237 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  55.74 
 
 		 263 aa  255  4e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  55.6 
 
 		 239 aa  255  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1197  uridylate kinase  53.19 
 
 		 241 aa  256  4e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000608645  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  55.17 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  52.59 
 
 		 235 aa  255  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  56.6 
 
 		 279 aa  255  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  54.11 
 
 		 237 aa  255  5e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  55.32 
 
 		 237 aa  255  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  54.11 
 
 		 237 aa  255  5e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  56.3 
 
 		 240 aa  254  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2477  uridylate kinase  56.71 
 
 		 240 aa  254  9e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000191921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  56.03 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  58.12 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  55.17 
 
 		 238 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  54.04 
 
 		 245 aa  253  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  54.31 
 
 		 245 aa  252  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  53.02 
 
 		 236 aa  252  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3515  uridylate kinase  59.66 
 
 		 235 aa  251  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459152  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3676  uridylate kinase  55.84 
 
 		 240 aa  251  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>