More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3993 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3993  uridylate kinase  100 
 
 		 244 aa  504  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.927712  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  86.07 
 
 		 246 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  85.66 
 
 		 246 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  85.66 
 
 		 246 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  87.93 
 
 		 243 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  85.71 
 
 		 249 aa  418  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1414  uridylate kinase  85.11 
 
 		 249 aa  413  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  67.69 
 
 		 241 aa  320  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  64.71 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  64.5 
 
 		 246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  63.68 
 
 		 239 aa  308  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  61.32 
 
 		 250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  62.34 
 
 		 245 aa  305  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  60.09 
 
 		 237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  62.5 
 
 		 241 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  63.25 
 
 		 241 aa  301  5.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  62.5 
 
 		 241 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  59.09 
 
 		 246 aa  298  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  58.09 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  58.09 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  58.09 
 
 		 251 aa  295  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  61.9 
 
 		 263 aa  293  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  61.21 
 
 		 237 aa  293  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  61.8 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  61.8 
 
 		 239 aa  292  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  61.37 
 
 		 239 aa  291  5e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  57.51 
 
 		 237 aa  291  6e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  59.4 
 
 		 253 aa  291  6e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  57.51 
 
 		 237 aa  291  6e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  61.8 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  59.74 
 
 		 237 aa  289  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  59.48 
 
 		 237 aa  289  3e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  61.37 
 
 		 239 aa  288  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  57.68 
 
 		 249 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  58.8 
 
 		 245 aa  287  9e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  57.69 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  58.67 
 
 		 237 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  64.76 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  63.39 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  62.95 
 
 		 240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0266  uridylate kinase  55.74 
 
 		 244 aa  285  5e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  57.94 
 
 		 241 aa  285  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  58.55 
 
 		 240 aa  284  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  60.52 
 
 		 238 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  58.33 
 
 		 236 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  60.94 
 
 		 238 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  57.78 
 
 		 234 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  57.69 
 
 		 240 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  59.91 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  58.8 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  58.47 
 
 		 240 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  56.89 
 
 		 234 aa  281  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  57.69 
 
 		 240 aa  281  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  57.78 
 
 		 234 aa  281  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0759  uridylate kinase  55.74 
 
 		 244 aa  279  2e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  57.33 
 
 		 239 aa  280  2e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  54.42 
 
 		 236 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  56.17 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  56.17 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  56.17 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  56.17 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  57.08 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  56.6 
 
 		 238 aa  279  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  56.17 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  56.17 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  57.26 
 
 		 240 aa  278  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  56.41 
 
 		 242 aa  278  4e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  57.08 
 
 		 242 aa  278  4e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  58.8 
 
 		 239 aa  278  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  56.17 
 
 		 286 aa  278  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  57.99 
 
 		 234 aa  278  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  55.17 
 
 		 235 aa  278  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  56.65 
 
 		 237 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  57.69 
 
 		 240 aa  278  8e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  56.65 
 
 		 237 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  56.65 
 
 		 237 aa  278  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  56.65 
 
 		 237 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  57.26 
 
 		 242 aa  278  8e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  57.26 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  56.03 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  56.6 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  56.6 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  56.41 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  56.84 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  56.22 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  56.6 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  58.8 
 
 		 238 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  58.01 
 
 		 237 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  52.56 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  56.03 
 
 		 236 aa  276  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  58.01 
 
 		 237 aa  275  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  57.58 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  54.74 
 
 		 238 aa  275  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  56.22 
 
 		 237 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  56.22 
 
 		 237 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  59.11 
 
 		 237 aa  274  9e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  53.42 
 
 		 237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  53.22 
 
 		 235 aa  273  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  57.45 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  54.94 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>