267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2085 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  100 
 
 		 231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  39.83 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  32.22 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  31.62 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  33.19 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  34.36 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  29.49 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  30 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  31.11 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  28.21 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  33.05 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  31.96 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  29.18 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  32.06 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  27.78 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  28.21 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  30 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  29 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  29.48 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  28.21 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  32.32 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  30.13 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  28.57 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  27.83 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  26.92 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  27.54 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  30.6 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  29.95 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  30.11 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  27.01 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  23.56 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  23.44 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  26.29 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  25.13 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  25.86 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  27.1 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  27.23 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  25.42 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  25.42 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  25.57 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  24.71 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1283  uridylate kinase  26.28 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000389997  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  25.29 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  25.95 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  25.49 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  25.49 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1543  uridylate kinase  27.43 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0610  uridylate kinase  27.43 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.139301  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  24 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  25.49 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  24.42 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3831  uridylate kinase  29.41 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  25.11 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  25.14 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  29.87 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  29.87 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  23.43 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf053  uridylate kinase  22.16 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  24.68 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  23.56 
 
 		 250 aa  52  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2438  uridylate kinase  24.15 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139798  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  23.68 
 
 		 235 aa  52  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0482  uridylate kinase  28.12 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  24.71 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  25.99 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  25.96 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  22.67 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  23.19 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  24.84 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  25.95 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  26.32 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  24.18 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  24 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  25 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1842  uridylate kinase  24.42 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3993  uridylate kinase  23.9 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.927712  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  25.29 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  25.29 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  24.84 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1369  uridylate kinase  25.32 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4437  uridylate kinase  27.63 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770833 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  24.05 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0266  uridylate kinase  23.3 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  23.19 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  25.62 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0527  uridylate kinase  24.14 
 
 		 246 aa  48.9  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  26.97 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  24.84 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  26.97 
 
 		 258 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1414  uridylate kinase  26.42 
 
 		 249 aa  48.9  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  25.33 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  26.67 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4151  uridylate kinase  22.28 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0537318  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  25.16 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1386  uridylate kinase  23.38 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0301  uridylate kinase  27.73 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.06889 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  25.95 
 
 		 241 aa  48.5  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  25.33 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  26.97 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  24.68 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>