More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0760 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  100 
 
 		 234 aa  461  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  65.07 
 
 		 229 aa  280  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  56.65 
 
 		 234 aa  263  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  54.27 
 
 		 236 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  50 
 
 		 235 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  48.83 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  45.74 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  45.28 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  43.63 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  45.83 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  47.83 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  44.44 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  43.14 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  42.36 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  42.01 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  37.05 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  43.14 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  40.19 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  43.37 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  42.51 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  36.71 
 
 		 227 aa  125  7e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  36.49 
 
 		 217 aa  118  6e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  39.69 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  32.88 
 
 		 226 aa  109  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  35 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  33.72 
 
 		 217 aa  101  9e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  30.4 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  37.63 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  30 
 
 		 231 aa  95.9  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  37.91 
 
 		 217 aa  95.5  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  31.62 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  34.01 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  33.5 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  31.98 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  32.49 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1160  uridylate kinase  33.16 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  30.18 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0596  UMP kinase  27.15 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  29.31 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1117  uridylate kinase  33.51 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2031  uridylate kinase  32.63 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1842  uridylate kinase  29.55 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  31.19 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  29.8 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  29.28 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  29.8 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  31.22 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  28.28 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4151  uridylate kinase  29.91 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0537318  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  31.38 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  26.86 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  30.3 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  29.39 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  31.98 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  31.1 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  30.11 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  31.46 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  31.22 
 
 		 245 aa  72  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  31.58 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  28.81 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  28.57 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  28.82 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2855  uridylate kinase  31.5 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654259  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  31.67 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3831  uridylate kinase  29.83 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  31.79 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  28.45 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  28.65 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  28.79 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13319  predicted protein  31.4 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.494059  normal  0.0799913 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  29.03 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  27.47 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  26.94 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  31.55 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1782  uridylate kinase  30.54 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000038351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  28.88 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2438  uridylate kinase  28.96 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139798  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  27.59 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_002978  WD0530  uridylate kinase  30.62 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  29.73 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  29.19 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1964  uridylate kinase  29.31 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.86122  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  28.85 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  27.78 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  27.78 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  28.38 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  27.78 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf053  uridylate kinase  29.03 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  30.65 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3266  uridylate kinase  29.61 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  28.38 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2826  uridylate kinase  30.5 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0266  uridylate kinase  26.73 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  28.33 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  31.05 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  28.7 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  27.14 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  26.29 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  28.5 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  28.19 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>