More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1294 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  100 
 
 		 239 aa  461  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  71.18 
 
 		 230 aa  317  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  70.34 
 
 		 242 aa  301  8.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  66.95 
 
 		 241 aa  291  7e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  62.71 
 
 		 241 aa  260  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  51.4 
 
 		 234 aa  214  9e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  50.43 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  47.98 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  49.77 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  45.05 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  48.64 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  44.3 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  43.86 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  42.54 
 
 		 225 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  44.74 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  44.74 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  45.78 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  44.39 
 
 		 234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  35.14 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  33.48 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  32.47 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  36.59 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  34.8 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  29.44 
 
 		 231 aa  98.2  9e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  33.17 
 
 		 217 aa  85.1  9e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  31.25 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  24.14 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  32.89 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  33.04 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  26.97 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  31.25 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  32.14 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  31.25 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  26.51 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  28.22 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  28.65 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  25.7 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0787  uridylate kinase  31.11 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  28.38 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  27.48 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  27.23 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  28.22 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  29.73 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  30.46 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3447  uridylate kinase  30.89 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.345639 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  29.77 
 
 		 261 aa  62  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  27.54 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  26.13 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  29.41 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  27.9 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  28.42 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  29.15 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  28.4 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  29.15 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0709  uridylate kinase  28.77 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  26.03 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  26.13 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2633  uridylate kinase  26.13 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000396495  normal  0.230715 
 
 
-
 
NC_002620  TC0049  uridylate kinase  29.95 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  27.05 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  29.47 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  32.05 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  29.23 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  27.04 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1538  uridylate kinase  30.49 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  27.05 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  26.82 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  28.32 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2220  uridylate kinase  29.19 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118147  normal  0.160064 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  25.68 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  25.68 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  25.68 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  29.31 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  29.31 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  25.68 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0240  uridylate kinase  28.3 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.432338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0256  uridylate kinase  28.3 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0240  uridylate kinase  28.3 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0258  uridylate kinase  28.3 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100769  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0243  uridylate kinase  28.3 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  25.68 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  25.56 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  28.3 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  26.85 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0828  uridylate kinase  25.71 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  25 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2639  uridylate kinase  25.68 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000176881  normal  0.106095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2706  uridylate kinase  25.68 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000157467  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  25.68 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00169  uridylate kinase  28.3 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0505974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3432  uridylate kinase  28.3 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0174185  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  28.32 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  25.68 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0164  uridylate kinase  28.3 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0156878  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0175  uridylate kinase  28.3 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  28.32 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0181  uridylate kinase  28.3 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000366692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0173  uridylate kinase  28.3 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120351  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3489  uridylate kinase  28.3 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.257153  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  25.23 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>