More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1538 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1538  uridylate kinase  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0631  uridylate kinase  95.42 
 
 		 240 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3447  uridylate kinase  89.17 
 
 		 246 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.345639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2349  uridylate kinase  87.5 
 
 		 240 aa  434  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2035  uridylate kinase  88.33 
 
 		 240 aa  434  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2075  uridylate kinase  87.5 
 
 		 240 aa  434  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.433019 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3831  uridylate kinase  58.33 
 
 		 252 aa  262  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4437  uridylate kinase  62.98 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0301  uridylate kinase  60.76 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.06889 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  52.52 
 
 		 246 aa  255  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  53.39 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2855  uridylate kinase  55.17 
 
 		 238 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654259  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  53.88 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3266  uridylate kinase  54.74 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  50.42 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2826  uridylate kinase  55.6 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  54.31 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  53.45 
 
 		 238 aa  244  9e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  51.26 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2438  uridylate kinase  52.59 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139798  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  51.07 
 
 		 245 aa  241  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  47.01 
 
 		 243 aa  239  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  51.06 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  50.64 
 
 		 237 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  51.29 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  51.29 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  51.29 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  51.29 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  51.29 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  51.29 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  50.64 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  50.64 
 
 		 237 aa  238  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  50.63 
 
 		 240 aa  238  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  50 
 
 		 236 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  50.86 
 
 		 242 aa  238  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  50.64 
 
 		 237 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  50.64 
 
 		 237 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  50.64 
 
 		 237 aa  238  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  50.64 
 
 		 237 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  50 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  50.86 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  48.98 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  51.29 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  50 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  50.85 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  49.57 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  49.57 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  49.57 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  50.85 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3993  uridylate kinase  48.15 
 
 		 244 aa  235  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.927712  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  49.14 
 
 		 236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  50.43 
 
 		 237 aa  234  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  44.83 
 
 		 235 aa  234  6e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  50 
 
 		 258 aa  234  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  47.84 
 
 		 241 aa  234  8e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  47.84 
 
 		 239 aa  234  8e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0266  uridylate kinase  46.28 
 
 		 244 aa  234  9e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  49.57 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  49.37 
 
 		 240 aa  233  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  49.37 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0787  uridylate kinase  56.22 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  49.37 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  46.41 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  50 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  47.48 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  47.41 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  49.37 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  46.55 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  45.99 
 
 		 246 aa  232  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  47.48 
 
 		 238 aa  232  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  45.53 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  47.7 
 
 		 241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  45.99 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  47.01 
 
 		 242 aa  231  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  47.7 
 
 		 240 aa  231  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  49.57 
 
 		 236 aa  231  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  50 
 
 		 242 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  49.14 
 
 		 247 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  48.54 
 
 		 240 aa  231  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  48.71 
 
 		 245 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  49.14 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  47.41 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  47.64 
 
 		 249 aa  230  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  47.41 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  45.76 
 
 		 239 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  49.14 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0759  uridylate kinase  46.69 
 
 		 244 aa  230  2e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  47.01 
 
 		 242 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  47.84 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  48.71 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  48.51 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  48.28 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  47.41 
 
 		 243 aa  229  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  48.71 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  45.06 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  48.28 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  48.71 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  48.71 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  45.06 
 
 		 244 aa  229  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2031  uridylate kinase  50.84 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>