More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2386 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  100 
 
 		 241 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  65.98 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  66.1 
 
 		 241 aa  279  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  63.04 
 
 		 230 aa  271  7e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  62.71 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  51.85 
 
 		 234 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  45.26 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  47.37 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  50.72 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  42.98 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  42.98 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  41.23 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  44.54 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  43.42 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  43.42 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  45.13 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  45.83 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  47.77 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  36.56 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  35.24 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  34.55 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  37.5 
 
 		 217 aa  102  7e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  34.38 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  32.75 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  32.48 
 
 		 226 aa  95.5  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  27.91 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  37.55 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  35.27 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  30.51 
 
 		 231 aa  86.3  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  35.71 
 
 		 217 aa  85.1  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  32.95 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  29.03 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  27.46 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  28.57 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  27.39 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1538  uridylate kinase  31.71 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  29.79 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  28.93 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  29.05 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  29.35 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  31.02 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3447  uridylate kinase  30.89 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.345639 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  30.27 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  28.09 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0482  uridylate kinase  24.9 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  29.79 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  29.19 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  27.39 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  28.93 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  29.75 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  28.42 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  28.22 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  28.33 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  28.93 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf053  uridylate kinase  25.64 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  27.03 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  34.04 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  25.89 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  27.57 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  29.41 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  27.8 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  27.8 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  28.09 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  31.11 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  26.97 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3111  uridylate kinase  31.18 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000029028  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  28.4 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  30.56 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  29.75 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2626  uridylate kinase  24.9 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000002022  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  27.27 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  31.35 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  29.91 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  30 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  27.66 
 
 		 245 aa  62  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1842  uridylate kinase  28.65 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  25.73 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  30.56 
 
 		 240 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  27.66 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  25.9 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  27.66 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  29.19 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  25.31 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2633  uridylate kinase  26.56 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000396495  normal  0.230715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  27.66 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  27.66 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1721  uridylate kinase  27.47 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  27.53 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2035  uridylate kinase  30.08 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  26.88 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  26.67 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  30.11 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  28.19 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  28.19 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  26.79 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2639  uridylate kinase  27.66 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000176881  normal  0.106095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2706  uridylate kinase  27.66 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000157467  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  27.66 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  28.11 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  26.27 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>