More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1253 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  100 
 
 		 225 aa  456  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  97.33 
 
 		 225 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  96.44 
 
 		 225 aa  418  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  79.11 
 
 		 225 aa  348  4e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  72 
 
 		 225 aa  338  4e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  48.15 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  46.93 
 
 		 242 aa  176  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  46.49 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  45.33 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  41.67 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  43.75 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  46.08 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  44.71 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  43.42 
 
 		 241 aa  155  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  40 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  43.5 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  43.14 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  36.59 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  39.33 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  35.4 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  32.91 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  34.16 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  36.45 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  36.73 
 
 		 217 aa  105  8e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  35.59 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  32.89 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  36.73 
 
 		 217 aa  95.9  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  32.37 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  28.63 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  30.9 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  30.96 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  32.07 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0482  uridylate kinase  28.51 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  30.64 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  30.64 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  33.15 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  34.24 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  33.15 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  34.24 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  33.15 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  33.15 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  34.24 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  33.15 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  34.43 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  34.24 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  34.24 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  30.54 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  31.35 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4151  uridylate kinase  33 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0537318  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  33.15 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2633  uridylate kinase  30.96 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000396495  normal  0.230715 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  28.27 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  32.61 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  31.87 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  33.7 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  32.07 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  33.33 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  33.54 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  30.43 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0530  uridylate kinase  31.69 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  32.07 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0266  uridylate kinase  31.89 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  32.61 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  32.4 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2639  uridylate kinase  32.07 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000176881  normal  0.106095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2706  uridylate kinase  32.07 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000157467  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  32.07 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  32.07 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  31.52 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  31.52 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  30.05 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  31.52 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  28.99 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  31.52 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0828  uridylate kinase  26.45 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  32.07 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1034  uridylate kinase  29.71 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115262  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  28.34 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  29.35 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  29.35 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  27.11 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  32.24 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2883  uridylate kinase  32.07 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000941193  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  28.87 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  28.99 
 
 		 274 aa  75.1  0.0000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0240  uridylate kinase  30.98 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  33.14 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  28.99 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  30.05 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  31.52 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  30.81 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0243  uridylate kinase  30.98 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0240  uridylate kinase  30.98 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.432338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  30.98 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0258  uridylate kinase  30.98 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0256  uridylate kinase  30.98 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1721  uridylate kinase  26.47 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  29.05 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  29.35 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>