More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1964 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  70.18 
 
 		 234 aa  317  7e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  65.07 
 
 		 234 aa  285  5e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  56.77 
 
 		 236 aa  265  4e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  56.64 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  46.45 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  47.37 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  45.87 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  48.61 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  46.67 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  43.95 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  48.36 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  43.95 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  45.91 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  45 
 
 		 241 aa  161  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  43.5 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  43.05 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  40.99 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  37.78 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  37.31 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  42.51 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  36.87 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  35.39 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  34.33 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  39.11 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  38.42 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  29.26 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  34.27 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  34.8 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  27.18 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0444  uridylate kinase  31.96 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.014483  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  31.67 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  31.28 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  30.36 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  34.91 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  31.98 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  31.82 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  32.29 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  31.84 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  32.29 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  30.04 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_004310  BR1160  uridylate kinase  33.15 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  31.53 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  31.84 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  31.73 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1117  uridylate kinase  33.15 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  30.59 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2031  uridylate kinase  33.15 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1383  uridylate kinase  34.18 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.862612  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  31.66 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  36.17 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  30.69 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  37.5 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  30.85 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  36.73 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2438  uridylate kinase  30.91 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139798  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  31.73 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  32.51 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  31.53 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  29.41 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  31.03 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  36.18 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4151  uridylate kinase  32.67 
 
 		 247 aa  72  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0537318  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  30 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  31.66 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  32.51 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  31.53 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  30.45 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  32.13 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  30.69 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  31.36 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  26.73 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  31.03 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0803  uridylate kinase  30.39 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000782599  hitchhiker  0.00000000000212773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  37.32 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  36.05 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  36.05 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  30.2 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  27.2 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0266  uridylate kinase  30.16 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  29.33 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  30.2 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  30.2 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  30.2 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  35.46 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  30.2 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  28.16 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  30.2 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  34.88 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  30.2 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  30.2 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  30.05 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  30 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1421  uridylate kinase  30.73 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0926362  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  30.54 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  31.19 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  30.58 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  34.69 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  31.68 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  36.17 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>