More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1383 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1383  uridylate kinase  100 
 
 		 247 aa  491  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.862612  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2031  uridylate kinase  82.2 
 
 		 240 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1117  uridylate kinase  81.36 
 
 		 323 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  73.08 
 
 		 239 aa  363  1e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1160  uridylate kinase  80.93 
 
 		 240 aa  361  5.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2524  uridylate kinase  75.85 
 
 		 240 aa  344  8.999999999999999e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831867  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1133  uridylate kinase  74.89 
 
 		 240 aa  339  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1778  uridylate kinase  72.69 
 
 		 240 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1585  uridylate kinase  72.69 
 
 		 240 aa  332  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  60.85 
 
 		 241 aa  289  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  57.94 
 
 		 238 aa  277  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  57.94 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  56.22 
 
 		 263 aa  276  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  58.26 
 
 		 246 aa  274  8e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  56.49 
 
 		 245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  55.32 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2438  uridylate kinase  57.51 
 
 		 238 aa  269  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139798  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  57.64 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  54.89 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  56.65 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  55.02 
 
 		 250 aa  262  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  53.81 
 
 		 244 aa  262  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0266  uridylate kinase  53.22 
 
 		 244 aa  262  4.999999999999999e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  51.67 
 
 		 247 aa  261  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  51.71 
 
 		 246 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  50.85 
 
 		 247 aa  261  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  53.85 
 
 		 239 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  54.98 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  51.49 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  53.42 
 
 		 239 aa  260  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  51.05 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  51.06 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  51.06 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  51.49 
 
 		 245 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  51.28 
 
 		 247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  53.59 
 
 		 242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0759  uridylate kinase  51.9 
 
 		 244 aa  258  6e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  52.12 
 
 		 243 aa  258  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  51.06 
 
 		 247 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  53.19 
 
 		 239 aa  258  7e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  52.59 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  52.59 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  52.59 
 
 		 246 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  52.36 
 
 		 243 aa  258  8e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  52.77 
 
 		 240 aa  258  9e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  51.71 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  50.85 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  52.77 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  52.14 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2855  uridylate kinase  53.65 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654259  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  51.67 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3266  uridylate kinase  53.65 
 
 		 238 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  51.72 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  52.16 
 
 		 235 aa  256  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  53.45 
 
 		 249 aa  255  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  51.5 
 
 		 241 aa  255  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  52.14 
 
 		 235 aa  255  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  49.58 
 
 		 249 aa  255  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  52.14 
 
 		 242 aa  255  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  51.93 
 
 		 243 aa  255  5e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  53.78 
 
 		 235 aa  254  7e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  52.28 
 
 		 242 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  51.84 
 
 		 246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3831  uridylate kinase  57.26 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  52.99 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2349  uridylate kinase  51.91 
 
 		 240 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  53.45 
 
 		 247 aa  252  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2075  uridylate kinase  51.91 
 
 		 240 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.433019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2595  uridylate kinase  50.85 
 
 		 247 aa  252  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151239  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  53.02 
 
 		 247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  49.37 
 
 		 245 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  50.85 
 
 		 236 aa  252  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3447  uridylate kinase  51.06 
 
 		 246 aa  251  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.345639 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  49.79 
 
 		 243 aa  251  7e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  53.42 
 
 		 240 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2826  uridylate kinase  53.22 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  52.14 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  52.4 
 
 		 247 aa  249  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  48.93 
 
 		 245 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  48.93 
 
 		 245 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  48.93 
 
 		 245 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  48.93 
 
 		 245 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  48.5 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3993  uridylate kinase  51.49 
 
 		 244 aa  248  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.927712  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  49.36 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0631  uridylate kinase  51.49 
 
 		 240 aa  248  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  51.33 
 
 		 244 aa  248  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  50.21 
 
 		 241 aa  248  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  49.36 
 
 		 245 aa  248  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  49.79 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  49.36 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  51.93 
 
 		 241 aa  247  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  49.79 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2979  uridylate kinase  49.58 
 
 		 243 aa  247  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  49.57 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  49.58 
 
 		 274 aa  246  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1538  uridylate kinase  51.49 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  50.21 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  51.45 
 
 		 242 aa  246  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3163  uridylate kinase  48.73 
 
 		 243 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>