More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1133 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1133  uridylate kinase  100 
 
 		 240 aa  477  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1585  uridylate kinase  89.17 
 
 		 240 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1778  uridylate kinase  88.75 
 
 		 240 aa  407  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2524  uridylate kinase  88.28 
 
 		 240 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831867  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2031  uridylate kinase  80 
 
 		 240 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1117  uridylate kinase  79.58 
 
 		 323 aa  368  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1160  uridylate kinase  79.17 
 
 		 240 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  72.96 
 
 		 239 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1383  uridylate kinase  74.89 
 
 		 247 aa  338  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.862612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  60 
 
 		 241 aa  298  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  60.26 
 
 		 238 aa  286  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  60.26 
 
 		 238 aa  287  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  58.37 
 
 		 263 aa  285  5.999999999999999e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2438  uridylate kinase  56.84 
 
 		 238 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139798  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  56.17 
 
 		 238 aa  271  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  57.02 
 
 		 245 aa  271  9e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  57.2 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3266  uridylate kinase  55.32 
 
 		 238 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  56.84 
 
 		 246 aa  268  5e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2855  uridylate kinase  55.56 
 
 		 238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654259  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  52.54 
 
 		 247 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  55.32 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  55.46 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  52.54 
 
 		 245 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  54.94 
 
 		 239 aa  265  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  52.54 
 
 		 245 aa  264  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  52.12 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  52.32 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  52.32 
 
 		 246 aa  263  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  52.12 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  54.08 
 
 		 240 aa  263  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  52.32 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  52.12 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2826  uridylate kinase  55.13 
 
 		 238 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  54.66 
 
 		 244 aa  262  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  54.51 
 
 		 239 aa  260  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  52.12 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3993  uridylate kinase  54.98 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.927712  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  51.69 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  52.54 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  53.68 
 
 		 239 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  54.55 
 
 		 239 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0759  uridylate kinase  52.14 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  53.22 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0266  uridylate kinase  52.14 
 
 		 244 aa  258  4e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  52.97 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  52.97 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  54.27 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00169  uridylate kinase  49.58 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0505974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3432  uridylate kinase  49.58 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0174185  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0243  uridylate kinase  49.58 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  54.55 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0256  uridylate kinase  49.58 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0182  uridylate kinase  49.58 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0585328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  54.51 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0240  uridylate kinase  49.58 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.432338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0240  uridylate kinase  49.58 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0258  uridylate kinase  49.58 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100769  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  54.01 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  51.08 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3489  uridylate kinase  49.58 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.257153  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0181  uridylate kinase  49.58 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000366692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0175  uridylate kinase  49.58 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000281467  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  50.63 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0173  uridylate kinase  49.58 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0164  uridylate kinase  49.58 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0156878  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  53.25 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  53.25 
 
 		 246 aa  255  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  53.25 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  52.38 
 
 		 235 aa  255  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  54.98 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  57.48 
 
 		 246 aa  255  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  53.19 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  54.27 
 
 		 242 aa  254  6e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  49.37 
 
 		 241 aa  254  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  49.58 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  53.22 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  51.49 
 
 		 243 aa  252  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  55.8 
 
 		 235 aa  251  6e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2595  uridylate kinase  51.52 
 
 		 247 aa  251  6e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0530  uridylate kinase  52.56 
 
 		 247 aa  251  7e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0709  uridylate kinase  47.9 
 
 		 241 aa  251  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  53.22 
 
 		 236 aa  251  8.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3358  uridylate kinase  48.1 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.386876  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  48.73 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3831  uridylate kinase  56.9 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  48.73 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3163  uridylate kinase  47.28 
 
 		 243 aa  250  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  48.31 
 
 		 241 aa  249  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  52.86 
 
 		 239 aa  249  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2979  uridylate kinase  48.12 
 
 		 243 aa  249  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  48.31 
 
 		 245 aa  249  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0631  uridylate kinase  51.26 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  51.5 
 
 		 237 aa  248  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  52.56 
 
 		 244 aa  248  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  49.16 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  51.9 
 
 		 238 aa  248  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  48.74 
 
 		 243 aa  248  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  47.68 
 
 		 241 aa  248  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  48.52 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>