More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3831 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3831  uridylate kinase  100 
 
 		 252 aa  507  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0301  uridylate kinase  85.17 
 
 		 252 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.06889 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3447  uridylate kinase  58.68 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.345639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0631  uridylate kinase  58.33 
 
 		 240 aa  288  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  60.34 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1538  uridylate kinase  58.33 
 
 		 240 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2035  uridylate kinase  58.33 
 
 		 240 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2349  uridylate kinase  57.92 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2075  uridylate kinase  57.92 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.433019 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  59.48 
 
 		 238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4437  uridylate kinase  63.79 
 
 		 257 aa  278  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  53.75 
 
 		 250 aa  278  7e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  54.08 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  59.48 
 
 		 238 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  55.17 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2438  uridylate kinase  57.76 
 
 		 238 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139798  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  54.51 
 
 		 245 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  51.84 
 
 		 246 aa  271  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  51.84 
 
 		 246 aa  271  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  51.84 
 
 		 246 aa  271  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2855  uridylate kinase  57.76 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654259  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  50.85 
 
 		 243 aa  268  8e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  51.02 
 
 		 263 aa  268  8e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  53.88 
 
 		 244 aa  268  8.999999999999999e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  52.46 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  53.85 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  51.91 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  51.72 
 
 		 239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  54.11 
 
 		 236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  53.42 
 
 		 237 aa  265  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  53.42 
 
 		 237 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  53.42 
 
 		 237 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  53.42 
 
 		 237 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  52.99 
 
 		 237 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  53.65 
 
 		 237 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  53.65 
 
 		 237 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  53.68 
 
 		 237 aa  264  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  53.68 
 
 		 237 aa  264  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  53.68 
 
 		 237 aa  264  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  53.68 
 
 		 237 aa  264  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  53.68 
 
 		 237 aa  264  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  53.68 
 
 		 237 aa  264  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  55.22 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  51.26 
 
 		 249 aa  264  8.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  53.68 
 
 		 286 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  53.65 
 
 		 237 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2826  uridylate kinase  56.9 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  53.25 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  53.25 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  54.87 
 
 		 237 aa  262  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  52.99 
 
 		 237 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  52.99 
 
 		 237 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  52.54 
 
 		 238 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  52.38 
 
 		 236 aa  259  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  52.61 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2583  uridylate kinase  52.14 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.0617202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1225  uridylate kinase  52.14 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0229654  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  52.81 
 
 		 236 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  51.23 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  52.81 
 
 		 236 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  52.38 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  53.25 
 
 		 236 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  49.58 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0530  uridylate kinase  50.64 
 
 		 247 aa  257  2e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  51.95 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3266  uridylate kinase  54.31 
 
 		 238 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  51.26 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1440  uridylate kinase  50.82 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3993  uridylate kinase  51.08 
 
 		 244 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.927712  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  52.38 
 
 		 236 aa  255  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2031  uridylate kinase  56.47 
 
 		 240 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  50.67 
 
 		 245 aa  255  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  50.22 
 
 		 251 aa  254  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  50.22 
 
 		 251 aa  254  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  51.29 
 
 		 240 aa  254  8e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0266  uridylate kinase  50.21 
 
 		 244 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  48.28 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1160  uridylate kinase  56.47 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  50.65 
 
 		 238 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2524  uridylate kinase  57.76 
 
 		 240 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831867  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1117  uridylate kinase  56.47 
 
 		 323 aa  252  5.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1383  uridylate kinase  57.02 
 
 		 247 aa  252  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.862612  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0610  uridylate kinase  49.59 
 
 		 243 aa  251  7e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.139301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1543  uridylate kinase  49.59 
 
 		 243 aa  251  7e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  50.67 
 
 		 249 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  48.07 
 
 		 235 aa  251  9.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  50.64 
 
 		 246 aa  251  9.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1414  uridylate kinase  49.19 
 
 		 249 aa  250  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  49.57 
 
 		 243 aa  250  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  50.22 
 
 		 236 aa  250  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  50.86 
 
 		 238 aa  250  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  49.57 
 
 		 243 aa  250  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1133  uridylate kinase  56.9 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1842  uridylate kinase  51.08 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  52.44 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  50.22 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  49.57 
 
 		 237 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0759  uridylate kinase  48.5 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  50.43 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  50.43 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>