More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1705 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  100 
 
 		 227 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  39.83 
 
 		 234 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  39.01 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  38.89 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  38.91 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  39.55 
 
 		 217 aa  133  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  38.43 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  42.57 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.020264 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  39.81 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  42.01 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  36.16 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  36.56 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  36.56 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  38.05 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  35.45 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  38.89 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  38.81 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  39.27 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  40.99 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  41.86 
 
 		 232 aa  119  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  37.71 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  37.29 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  35.15 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  38.2 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  35.64 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  37.1 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  39.01 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  34.16 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  31.02 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  32.77 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4515  uridylate kinase  30 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2855  uridylate kinase  27.8 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654259  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  30.29 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1857  uridylate kinase  28.03 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  0.0309291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2826  uridylate kinase  27.98 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  29.88 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  29.88 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  29.46 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  30 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  30 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  28.63 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3266  uridylate kinase  28.45 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  28.45 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  28.63 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  27.5 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  29.34 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2438  uridylate kinase  28.27 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139798  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  29.75 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  30.17 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1319  uridylate kinase  29.39 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.169344 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  29.92 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  28.03 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  29.05 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  30.45 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  27.8 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  27.8 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1344  uridylate kinase  29.65 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0550338  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1318  uridylate kinase  29.65 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.730256  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2349  uridylate kinase  28.16 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.594703 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  29.67 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  29.49 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2075  uridylate kinase  28.16 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.433019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  28.22 
 
 		 244 aa  72  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  28.16 
 
 		 240 aa  72  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3447  uridylate kinase  28.86 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.67051  normal  0.345639 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  28.74 
 
 		 237 aa  72  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0580  uridylate kinase  29.37 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0828  uridylate kinase  28.86 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0444  uridylate kinase  28.51 
 
 		 235 aa  72  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.014483  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  29.51 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0608  uridylate kinase  29.22 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000356345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  28.34 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  30.48 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0825  uridylate kinase  28.89 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000673854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  26.34 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  26.34 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  26.34 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  26.34 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  25.93 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2017  uridylate kinase  27.92 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920693  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  26.34 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  28.23 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  30.2 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  26.34 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  28.34 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  32.5 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  26.34 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  26.34 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3927  uridylate kinase  27.08 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  26.34 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  29.27 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  30.58 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  26.86 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  26.34 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  25.93 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  26.34 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  26.34 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  26.34 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  31.72 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0744  uridylate kinase  27.12 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000716266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>